Protein–RNA interactions for Protein: P0DP23

CALM1, Calmodulin-1, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALM1P0DP23 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CALM1P0DP23 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CALM1P0DP23 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CALM1P0DP23 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CALM1P0DP23 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CALM1P0DP23 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CALM1P0DP23 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CALM1P0DP23 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CALM1P0DP23 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CALM1P0DP23 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CALM1P0DP23 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CALM1P0DP23 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CALM1P0DP23 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CALM1P0DP23 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CALM1P0DP23 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CALM1P0DP23 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CALM1P0DP23 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CALM1P0DP23 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CALM1P0DP23 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CALM1P0DP23 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CALM1P0DP23 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CALM1P0DP23 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CALM1P0DP23 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CALM1P0DP23 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CALM1P0DP23 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CALM1P0DP23 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CALM1P0DP23 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CALM1P0DP23 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CALM1P0DP23 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CALM1P0DP23 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CALM1P0DP23 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CALM1P0DP23 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CALM1P0DP23 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CALM1P0DP23 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CALM1P0DP23 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CALM1P0DP23 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CALM1P0DP23 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CALM1P0DP23 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CALM1P0DP23 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CALM1P0DP23 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CALM1P0DP23 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CALM1P0DP23 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CALM1P0DP23 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CALM1P0DP23 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CALM1P0DP23 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CALM1P0DP23 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CALM1P0DP23 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CALM1P0DP23 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CALM1P0DP23 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CALM1P0DP23 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CALM1P0DP23 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CALM1P0DP23 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CALM1P0DP23 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CALM1P0DP23 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CALM1P0DP23 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CALM1P0DP23 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CALM1P0DP23 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CALM1P0DP23 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CALM1P0DP23 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CALM1P0DP23 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CALM1P0DP23 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CALM1P0DP23 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CALM1P0DP23 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CALM1P0DP23 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CALM1P0DP23 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CALM1P0DP23 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CALM1P0DP23 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CALM1P0DP23 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CALM1P0DP23 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CALM1P0DP23 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CALM1P0DP23 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CALM1P0DP23 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CALM1P0DP23 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CALM1P0DP23 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CALM1P0DP23 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CALM1P0DP23 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CALM1P0DP23 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CALM1P0DP23 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CALM1P0DP23 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CALM1P0DP23 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CALM1P0DP23 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CALM1P0DP23 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CALM1P0DP23 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CALM1P0DP23 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CALM1P0DP23 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CALM1P0DP23 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CALM1P0DP23 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CALM1P0DP23 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CALM1P0DP23 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CALM1P0DP23 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CALM1P0DP23 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CALM1P0DP23 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CALM1P0DP23 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CALM1P0DP23 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CALM1P0DP23 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CALM1P0DP23 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CALM1P0DP23 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CALM1P0DP23 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CALM1P0DP23 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CALM1P0DP23 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms