Protein–RNA interactions for Protein: P0DP09

IGKV1-13, Immunoglobulin kappa variable 1-13, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1-13P0DP09 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IGKV1-13P0DP09 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
IGKV1-13P0DP09 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IGKV1-13P0DP09 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IGKV1-13P0DP09 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IGKV1-13P0DP09 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IGKV1-13P0DP09 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
IGKV1-13P0DP09 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IGKV1-13P0DP09 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
IGKV1-13P0DP09 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IGKV1-13P0DP09 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IGKV1-13P0DP09 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IGKV1-13P0DP09 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IGKV1-13P0DP09 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IGKV1-13P0DP09 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IGKV1-13P0DP09 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IGKV1-13P0DP09 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IGKV1-13P0DP09 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IGKV1-13P0DP09 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IGKV1-13P0DP09 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IGKV1-13P0DP09 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IGKV1-13P0DP09 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
IGKV1-13P0DP09 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IGKV1-13P0DP09 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IGKV1-13P0DP09 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IGKV1-13P0DP09 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IGKV1-13P0DP09 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IGKV1-13P0DP09 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IGKV1-13P0DP09 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IGKV1-13P0DP09 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IGKV1-13P0DP09 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IGKV1-13P0DP09 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IGKV1-13P0DP09 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
IGKV1-13P0DP09 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IGKV1-13P0DP09 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IGKV1-13P0DP09 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IGKV1-13P0DP09 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IGKV1-13P0DP09 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IGKV1-13P0DP09 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IGKV1-13P0DP09 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IGKV1-13P0DP09 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IGKV1-13P0DP09 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IGKV1-13P0DP09 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IGKV1-13P0DP09 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IGKV1-13P0DP09 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IGKV1-13P0DP09 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IGKV1-13P0DP09 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
IGKV1-13P0DP09 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
IGKV1-13P0DP09 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
IGKV1-13P0DP09 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IGKV1-13P0DP09 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IGKV1-13P0DP09 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IGKV1-13P0DP09 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IGKV1-13P0DP09 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IGKV1-13P0DP09 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IGKV1-13P0DP09 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IGKV1-13P0DP09 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IGKV1-13P0DP09 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IGKV1-13P0DP09 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IGKV1-13P0DP09 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IGKV1-13P0DP09 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IGKV1-13P0DP09 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IGKV1-13P0DP09 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IGKV1-13P0DP09 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IGKV1-13P0DP09 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IGKV1-13P0DP09 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IGKV1-13P0DP09 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IGKV1-13P0DP09 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IGKV1-13P0DP09 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
IGKV1-13P0DP09 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IGKV1-13P0DP09 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IGKV1-13P0DP09 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IGKV1-13P0DP09 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IGKV1-13P0DP09 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IGKV1-13P0DP09 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IGKV1-13P0DP09 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IGKV1-13P0DP09 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IGKV1-13P0DP09 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IGKV1-13P0DP09 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IGKV1-13P0DP09 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IGKV1-13P0DP09 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IGKV1-13P0DP09 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IGKV1-13P0DP09 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IGKV1-13P0DP09 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IGKV1-13P0DP09 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IGKV1-13P0DP09 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IGKV1-13P0DP09 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IGKV1-13P0DP09 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IGKV1-13P0DP09 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IGKV1-13P0DP09 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IGKV1-13P0DP09 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IGKV1-13P0DP09 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IGKV1-13P0DP09 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IGKV1-13P0DP09 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IGKV1-13P0DP09 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IGKV1-13P0DP09 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IGKV1-13P0DP09 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IGKV1-13P0DP09 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
IGKV1-13P0DP09 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IGKV1-13P0DP09 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms