Protein–RNA interactions for Protein: P0DJI9

SAA2, Serum amyloid A-2 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAA2P0DJI9 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SAA2P0DJI9 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SAA2P0DJI9 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SAA2P0DJI9 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SAA2P0DJI9 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SAA2P0DJI9 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SAA2P0DJI9 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SAA2P0DJI9 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SAA2P0DJI9 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SAA2P0DJI9 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAA2P0DJI9 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAA2P0DJI9 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms