Protein–RNA interactions for Protein: P0CW27

CCDC166, Coiled-coil domain-containing protein 166, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC166P0CW27 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC166P0CW27 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC166P0CW27 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC166P0CW27 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC166P0CW27 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC166P0CW27 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC166P0CW27 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC166P0CW27 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC166P0CW27 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC166P0CW27 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC166P0CW27 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC166P0CW27 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC166P0CW27 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC166P0CW27 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC166P0CW27 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC166P0CW27 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC166P0CW27 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC166P0CW27 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC166P0CW27 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC166P0CW27 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC166P0CW27 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC166P0CW27 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC166P0CW27 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC166P0CW27 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC166P0CW27 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC166P0CW27 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC166P0CW27 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC166P0CW27 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC166P0CW27 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC166P0CW27 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC166P0CW27 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC166P0CW27 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC166P0CW27 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC166P0CW27 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC166P0CW27 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC166P0CW27 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC166P0CW27 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC166P0CW27 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC166P0CW27 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC166P0CW27 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC166P0CW27 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC166P0CW27 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC166P0CW27 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC166P0CW27 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC166P0CW27 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC166P0CW27 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC166P0CW27 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC166P0CW27 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC166P0CW27 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC166P0CW27 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC166P0CW27 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC166P0CW27 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC166P0CW27 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC166P0CW27 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC166P0CW27 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC166P0CW27 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC166P0CW27 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC166P0CW27 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC166P0CW27 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC166P0CW27 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC166P0CW27 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC166P0CW27 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC166P0CW27 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC166P0CW27 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC166P0CW27 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC166P0CW27 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC166P0CW27 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC166P0CW27 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC166P0CW27 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC166P0CW27 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC166P0CW27 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC166P0CW27 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC166P0CW27 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC166P0CW27 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC166P0CW27 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC166P0CW27 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC166P0CW27 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC166P0CW27 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC166P0CW27 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC166P0CW27 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC166P0CW27 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC166P0CW27 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC166P0CW27 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC166P0CW27 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC166P0CW27 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC166P0CW27 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC166P0CW27 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC166P0CW27 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC166P0CW27 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC166P0CW27 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC166P0CW27 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC166P0CW27 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC166P0CW27 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC166P0CW27 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC166P0CW27 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC166P0CW27 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC166P0CW27 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC166P0CW27 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC166P0CW27 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC166P0CW27 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms