Protein–RNA interactions for Protein: P0CB47

UBTFL1, Upstream-binding factor 1-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBTFL1P0CB47 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBTFL1P0CB47 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBTFL1P0CB47 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBTFL1P0CB47 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBTFL1P0CB47 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBTFL1P0CB47 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBTFL1P0CB47 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBTFL1P0CB47 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBTFL1P0CB47 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBTFL1P0CB47 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBTFL1P0CB47 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBTFL1P0CB47 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBTFL1P0CB47 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBTFL1P0CB47 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBTFL1P0CB47 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
UBTFL1P0CB47 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBTFL1P0CB47 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBTFL1P0CB47 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBTFL1P0CB47 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBTFL1P0CB47 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBTFL1P0CB47 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBTFL1P0CB47 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBTFL1P0CB47 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBTFL1P0CB47 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBTFL1P0CB47 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBTFL1P0CB47 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBTFL1P0CB47 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBTFL1P0CB47 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBTFL1P0CB47 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
UBTFL1P0CB47 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBTFL1P0CB47 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
UBTFL1P0CB47 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBTFL1P0CB47 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBTFL1P0CB47 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBTFL1P0CB47 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBTFL1P0CB47 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBTFL1P0CB47 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBTFL1P0CB47 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBTFL1P0CB47 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBTFL1P0CB47 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBTFL1P0CB47 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBTFL1P0CB47 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBTFL1P0CB47 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBTFL1P0CB47 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBTFL1P0CB47 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBTFL1P0CB47 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBTFL1P0CB47 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBTFL1P0CB47 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBTFL1P0CB47 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBTFL1P0CB47 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBTFL1P0CB47 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBTFL1P0CB47 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBTFL1P0CB47 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBTFL1P0CB47 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBTFL1P0CB47 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBTFL1P0CB47 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBTFL1P0CB47 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBTFL1P0CB47 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBTFL1P0CB47 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBTFL1P0CB47 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBTFL1P0CB47 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
UBTFL1P0CB47 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
UBTFL1P0CB47 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBTFL1P0CB47 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBTFL1P0CB47 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBTFL1P0CB47 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBTFL1P0CB47 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBTFL1P0CB47 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBTFL1P0CB47 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBTFL1P0CB47 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBTFL1P0CB47 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBTFL1P0CB47 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBTFL1P0CB47 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBTFL1P0CB47 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBTFL1P0CB47 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBTFL1P0CB47 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBTFL1P0CB47 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBTFL1P0CB47 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBTFL1P0CB47 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBTFL1P0CB47 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBTFL1P0CB47 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBTFL1P0CB47 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBTFL1P0CB47 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
UBTFL1P0CB47 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UBTFL1P0CB47 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UBTFL1P0CB47 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
UBTFL1P0CB47 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
UBTFL1P0CB47 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UBTFL1P0CB47 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
UBTFL1P0CB47 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
UBTFL1P0CB47 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UBTFL1P0CB47 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UBTFL1P0CB47 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
UBTFL1P0CB47 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
UBTFL1P0CB47 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UBTFL1P0CB47 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UBTFL1P0CB47 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
UBTFL1P0CB47 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
UBTFL1P0CB47 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
UBTFL1P0CB47 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms