Protein–RNA interactions for Protein: P07498

CSN3, Kappa-casein, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSN3P07498 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSN3P07498 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSN3P07498 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSN3P07498 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSN3P07498 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CSN3P07498 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CSN3P07498 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSN3P07498 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSN3P07498 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSN3P07498 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CSN3P07498 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSN3P07498 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSN3P07498 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSN3P07498 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSN3P07498 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSN3P07498 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSN3P07498 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSN3P07498 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSN3P07498 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSN3P07498 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSN3P07498 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSN3P07498 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSN3P07498 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSN3P07498 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSN3P07498 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSN3P07498 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSN3P07498 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSN3P07498 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSN3P07498 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSN3P07498 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSN3P07498 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CSN3P07498 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSN3P07498 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSN3P07498 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSN3P07498 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSN3P07498 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSN3P07498 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSN3P07498 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CSN3P07498 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSN3P07498 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSN3P07498 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CSN3P07498 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSN3P07498 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSN3P07498 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSN3P07498 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CSN3P07498 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSN3P07498 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSN3P07498 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSN3P07498 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSN3P07498 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSN3P07498 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSN3P07498 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSN3P07498 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSN3P07498 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSN3P07498 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSN3P07498 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSN3P07498 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSN3P07498 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSN3P07498 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSN3P07498 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSN3P07498 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSN3P07498 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSN3P07498 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSN3P07498 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSN3P07498 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSN3P07498 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSN3P07498 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CSN3P07498 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSN3P07498 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CSN3P07498 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CSN3P07498 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSN3P07498 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSN3P07498 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSN3P07498 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSN3P07498 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSN3P07498 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CSN3P07498 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSN3P07498 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSN3P07498 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSN3P07498 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSN3P07498 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSN3P07498 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSN3P07498 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSN3P07498 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSN3P07498 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSN3P07498 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSN3P07498 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSN3P07498 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSN3P07498 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSN3P07498 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSN3P07498 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSN3P07498 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSN3P07498 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSN3P07498 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSN3P07498 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSN3P07498 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSN3P07498 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSN3P07498 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSN3P07498 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSN3P07498 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms