Protein–RNA interactions for Protein: P05160

F13B, Coagulation factor XIII B chain, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13BP05160 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
F13BP05160 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
F13BP05160 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
F13BP05160 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
F13BP05160 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
F13BP05160 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
F13BP05160 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
F13BP05160 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
F13BP05160 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
F13BP05160 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
F13BP05160 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
F13BP05160 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
F13BP05160 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
F13BP05160 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
F13BP05160 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
F13BP05160 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
F13BP05160 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
F13BP05160 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
F13BP05160 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
F13BP05160 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
F13BP05160 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
F13BP05160 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
F13BP05160 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
F13BP05160 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
F13BP05160 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
F13BP05160 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
F13BP05160 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
F13BP05160 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
F13BP05160 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
F13BP05160 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
F13BP05160 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
F13BP05160 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
F13BP05160 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
F13BP05160 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
F13BP05160 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
F13BP05160 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
F13BP05160 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
F13BP05160 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
F13BP05160 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
F13BP05160 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
F13BP05160 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
F13BP05160 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
F13BP05160 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
F13BP05160 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
F13BP05160 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
F13BP05160 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
F13BP05160 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
F13BP05160 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
F13BP05160 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
F13BP05160 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
F13BP05160 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
F13BP05160 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
F13BP05160 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
F13BP05160 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
F13BP05160 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
F13BP05160 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
F13BP05160 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
F13BP05160 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
F13BP05160 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
F13BP05160 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
F13BP05160 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
F13BP05160 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
F13BP05160 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
F13BP05160 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
F13BP05160 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
F13BP05160 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
F13BP05160 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
F13BP05160 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
F13BP05160 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
F13BP05160 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
F13BP05160 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
F13BP05160 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
F13BP05160 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
F13BP05160 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
F13BP05160 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
F13BP05160 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
F13BP05160 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
F13BP05160 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
F13BP05160 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
F13BP05160 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
F13BP05160 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
F13BP05160 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
F13BP05160 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
F13BP05160 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
F13BP05160 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
F13BP05160 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
F13BP05160 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
F13BP05160 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
F13BP05160 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
F13BP05160 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
F13BP05160 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
F13BP05160 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
F13BP05160 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
F13BP05160 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
F13BP05160 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
F13BP05160 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
F13BP05160 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
F13BP05160 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
F13BP05160 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
F13BP05160 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms