Protein–RNA interactions for Protein: P02656

APOC3, Apolipoprotein C-III, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC3P02656 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOC3P02656 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOC3P02656 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOC3P02656 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOC3P02656 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOC3P02656 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOC3P02656 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOC3P02656 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOC3P02656 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOC3P02656 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOC3P02656 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOC3P02656 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOC3P02656 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOC3P02656 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOC3P02656 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOC3P02656 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOC3P02656 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOC3P02656 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOC3P02656 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOC3P02656 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOC3P02656 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOC3P02656 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOC3P02656 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOC3P02656 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOC3P02656 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOC3P02656 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOC3P02656 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOC3P02656 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOC3P02656 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOC3P02656 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOC3P02656 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOC3P02656 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOC3P02656 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOC3P02656 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOC3P02656 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOC3P02656 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOC3P02656 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOC3P02656 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOC3P02656 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOC3P02656 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOC3P02656 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
APOC3P02656 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
APOC3P02656 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
APOC3P02656 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
APOC3P02656 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
APOC3P02656 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
APOC3P02656 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
APOC3P02656 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
APOC3P02656 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
APOC3P02656 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOC3P02656 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOC3P02656 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOC3P02656 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOC3P02656 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOC3P02656 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOC3P02656 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOC3P02656 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOC3P02656 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
APOC3P02656 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
APOC3P02656 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOC3P02656 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOC3P02656 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOC3P02656 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOC3P02656 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOC3P02656 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOC3P02656 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOC3P02656 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOC3P02656 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOC3P02656 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOC3P02656 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOC3P02656 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOC3P02656 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOC3P02656 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOC3P02656 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOC3P02656 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOC3P02656 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOC3P02656 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOC3P02656 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
APOC3P02656 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOC3P02656 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOC3P02656 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOC3P02656 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
APOC3P02656 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
APOC3P02656 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOC3P02656 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOC3P02656 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOC3P02656 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOC3P02656 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOC3P02656 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOC3P02656 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOC3P02656 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOC3P02656 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOC3P02656 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOC3P02656 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOC3P02656 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOC3P02656 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOC3P02656 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOC3P02656 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOC3P02656 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOC3P02656 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms