Protein–RNA interactions for Protein: P02549

SPTA1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTA1P02549 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPTA1P02549 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPTA1P02549 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPTA1P02549 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPTA1P02549 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPTA1P02549 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPTA1P02549 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPTA1P02549 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPTA1P02549 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPTA1P02549 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPTA1P02549 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SPTA1P02549 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPTA1P02549 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPTA1P02549 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPTA1P02549 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPTA1P02549 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPTA1P02549 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPTA1P02549 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SPTA1P02549 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPTA1P02549 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPTA1P02549 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPTA1P02549 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPTA1P02549 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPTA1P02549 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SPTA1P02549 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPTA1P02549 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPTA1P02549 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SPTA1P02549 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPTA1P02549 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPTA1P02549 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPTA1P02549 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPTA1P02549 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPTA1P02549 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPTA1P02549 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPTA1P02549 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPTA1P02549 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPTA1P02549 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPTA1P02549 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPTA1P02549 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPTA1P02549 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPTA1P02549 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPTA1P02549 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPTA1P02549 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPTA1P02549 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPTA1P02549 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPTA1P02549 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SPTA1P02549 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SPTA1P02549 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SPTA1P02549 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPTA1P02549 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPTA1P02549 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPTA1P02549 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPTA1P02549 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPTA1P02549 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPTA1P02549 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPTA1P02549 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPTA1P02549 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPTA1P02549 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPTA1P02549 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPTA1P02549 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPTA1P02549 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPTA1P02549 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPTA1P02549 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPTA1P02549 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPTA1P02549 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPTA1P02549 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SPTA1P02549 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPTA1P02549 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPTA1P02549 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPTA1P02549 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPTA1P02549 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPTA1P02549 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SPTA1P02549 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SPTA1P02549 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPTA1P02549 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPTA1P02549 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPTA1P02549 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPTA1P02549 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPTA1P02549 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPTA1P02549 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPTA1P02549 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPTA1P02549 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPTA1P02549 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPTA1P02549 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SPTA1P02549 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPTA1P02549 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPTA1P02549 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPTA1P02549 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPTA1P02549 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPTA1P02549 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPTA1P02549 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SPTA1P02549 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPTA1P02549 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPTA1P02549 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SPTA1P02549 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SPTA1P02549 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SPTA1P02549 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPTA1P02549 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPTA1P02549 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPTA1P02549 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms