Protein–RNA interactions for Protein: P01730

CD4, T-cell surface glycoprotein CD4, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD4P01730 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD4P01730 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD4P01730 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD4P01730 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD4P01730 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD4P01730 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD4P01730 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD4P01730 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD4P01730 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD4P01730 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD4P01730 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD4P01730 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD4P01730 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD4P01730 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD4P01730 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD4P01730 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD4P01730 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD4P01730 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD4P01730 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD4P01730 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD4P01730 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CD4P01730 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD4P01730 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD4P01730 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD4P01730 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD4P01730 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD4P01730 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD4P01730 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD4P01730 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD4P01730 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD4P01730 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD4P01730 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD4P01730 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD4P01730 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD4P01730 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD4P01730 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD4P01730 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD4P01730 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD4P01730 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD4P01730 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD4P01730 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD4P01730 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD4P01730 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD4P01730 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CD4P01730 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD4P01730 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD4P01730 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD4P01730 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD4P01730 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD4P01730 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD4P01730 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD4P01730 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD4P01730 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD4P01730 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD4P01730 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CD4P01730 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD4P01730 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD4P01730 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD4P01730 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD4P01730 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD4P01730 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD4P01730 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD4P01730 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD4P01730 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD4P01730 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD4P01730 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CD4P01730 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CD4P01730 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD4P01730 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD4P01730 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD4P01730 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD4P01730 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD4P01730 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD4P01730 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD4P01730 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD4P01730 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD4P01730 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD4P01730 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD4P01730 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD4P01730 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD4P01730 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD4P01730 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD4P01730 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD4P01730 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD4P01730 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD4P01730 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD4P01730 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD4P01730 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD4P01730 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD4P01730 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CD4P01730 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD4P01730 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD4P01730 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD4P01730 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD4P01730 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD4P01730 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD4P01730 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CD4P01730 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD4P01730 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD4P01730 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms