Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZBED1O96006 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZBED1O96006 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZBED1O96006 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZBED1O96006 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZBED1O96006 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZBED1O96006 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ZBED1O96006 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZBED1O96006 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZBED1O96006 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZBED1O96006 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ZBED1O96006 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZBED1O96006 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZBED1O96006 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZBED1O96006 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZBED1O96006 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZBED1O96006 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZBED1O96006 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZBED1O96006 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZBED1O96006 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZBED1O96006 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZBED1O96006 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZBED1O96006 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZBED1O96006 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZBED1O96006 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZBED1O96006 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZBED1O96006 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZBED1O96006 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZBED1O96006 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZBED1O96006 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZBED1O96006 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ZBED1O96006 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZBED1O96006 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZBED1O96006 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ZBED1O96006 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZBED1O96006 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZBED1O96006 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZBED1O96006 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZBED1O96006 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZBED1O96006 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZBED1O96006 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZBED1O96006 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZBED1O96006 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZBED1O96006 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZBED1O96006 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZBED1O96006 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZBED1O96006 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZBED1O96006 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZBED1O96006 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZBED1O96006 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZBED1O96006 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZBED1O96006 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZBED1O96006 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZBED1O96006 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZBED1O96006 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZBED1O96006 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZBED1O96006 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZBED1O96006 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZBED1O96006 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZBED1O96006 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZBED1O96006 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZBED1O96006 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZBED1O96006 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZBED1O96006 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZBED1O96006 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZBED1O96006 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZBED1O96006 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZBED1O96006 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZBED1O96006 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZBED1O96006 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZBED1O96006 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZBED1O96006 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZBED1O96006 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZBED1O96006 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZBED1O96006 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZBED1O96006 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZBED1O96006 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZBED1O96006 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZBED1O96006 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZBED1O96006 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ZBED1O96006 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZBED1O96006 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZBED1O96006 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZBED1O96006 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZBED1O96006 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ZBED1O96006 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZBED1O96006 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZBED1O96006 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZBED1O96006 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZBED1O96006 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZBED1O96006 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZBED1O96006 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZBED1O96006 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZBED1O96006 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZBED1O96006 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZBED1O96006 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZBED1O96006 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZBED1O96006 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZBED1O96006 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZBED1O96006 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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