Protein–RNA interactions for Protein: O95749

GGPS1, Geranylgeranyl pyrophosphate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGPS1O95749 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GGPS1O95749 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GGPS1O95749 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GGPS1O95749 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GGPS1O95749 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GGPS1O95749 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GGPS1O95749 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GGPS1O95749 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GGPS1O95749 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GGPS1O95749 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GGPS1O95749 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GGPS1O95749 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GGPS1O95749 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GGPS1O95749 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GGPS1O95749 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GGPS1O95749 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GGPS1O95749 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GGPS1O95749 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GGPS1O95749 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GGPS1O95749 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GGPS1O95749 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GGPS1O95749 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GGPS1O95749 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GGPS1O95749 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GGPS1O95749 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GGPS1O95749 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GGPS1O95749 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GGPS1O95749 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GGPS1O95749 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GGPS1O95749 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GGPS1O95749 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GGPS1O95749 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GGPS1O95749 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GGPS1O95749 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GGPS1O95749 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GGPS1O95749 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GGPS1O95749 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GGPS1O95749 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GGPS1O95749 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GGPS1O95749 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GGPS1O95749 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GGPS1O95749 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GGPS1O95749 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GGPS1O95749 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GGPS1O95749 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GGPS1O95749 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GGPS1O95749 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GGPS1O95749 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GGPS1O95749 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GGPS1O95749 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GGPS1O95749 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GGPS1O95749 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GGPS1O95749 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GGPS1O95749 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GGPS1O95749 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GGPS1O95749 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GGPS1O95749 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GGPS1O95749 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GGPS1O95749 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GGPS1O95749 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GGPS1O95749 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GGPS1O95749 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GGPS1O95749 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GGPS1O95749 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GGPS1O95749 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GGPS1O95749 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GGPS1O95749 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GGPS1O95749 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GGPS1O95749 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GGPS1O95749 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GGPS1O95749 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GGPS1O95749 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GGPS1O95749 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GGPS1O95749 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GGPS1O95749 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GGPS1O95749 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GGPS1O95749 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GGPS1O95749 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GGPS1O95749 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GGPS1O95749 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GGPS1O95749 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GGPS1O95749 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GGPS1O95749 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GGPS1O95749 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GGPS1O95749 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GGPS1O95749 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GGPS1O95749 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GGPS1O95749 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GGPS1O95749 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GGPS1O95749 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GGPS1O95749 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GGPS1O95749 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GGPS1O95749 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GGPS1O95749 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GGPS1O95749 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GGPS1O95749 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GGPS1O95749 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GGPS1O95749 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GGPS1O95749 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GGPS1O95749 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms