Protein–RNA interactions for Protein: O75379

VAMP4, Vesicle-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP4O75379 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VAMP4O75379 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
VAMP4O75379 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VAMP4O75379 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VAMP4O75379 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VAMP4O75379 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VAMP4O75379 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VAMP4O75379 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VAMP4O75379 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VAMP4O75379 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
VAMP4O75379 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VAMP4O75379 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
VAMP4O75379 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VAMP4O75379 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VAMP4O75379 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
VAMP4O75379 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
VAMP4O75379 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
VAMP4O75379 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
VAMP4O75379 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
VAMP4O75379 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VAMP4O75379 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
VAMP4O75379 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
VAMP4O75379 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
VAMP4O75379 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VAMP4O75379 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
VAMP4O75379 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
VAMP4O75379 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VAMP4O75379 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
VAMP4O75379 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
VAMP4O75379 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
VAMP4O75379 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
VAMP4O75379 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
VAMP4O75379 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
VAMP4O75379 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
VAMP4O75379 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
VAMP4O75379 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
VAMP4O75379 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
VAMP4O75379 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
VAMP4O75379 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
VAMP4O75379 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
VAMP4O75379 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
VAMP4O75379 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
VAMP4O75379 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
VAMP4O75379 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
VAMP4O75379 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
VAMP4O75379 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
VAMP4O75379 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
VAMP4O75379 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
VAMP4O75379 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
VAMP4O75379 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
VAMP4O75379 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
VAMP4O75379 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
VAMP4O75379 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VAMP4O75379 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VAMP4O75379 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
VAMP4O75379 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
VAMP4O75379 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VAMP4O75379 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VAMP4O75379 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
VAMP4O75379 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
VAMP4O75379 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VAMP4O75379 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
VAMP4O75379 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
VAMP4O75379 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
VAMP4O75379 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
VAMP4O75379 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
VAMP4O75379 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
VAMP4O75379 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
VAMP4O75379 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
VAMP4O75379 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
VAMP4O75379 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
VAMP4O75379 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
VAMP4O75379 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
VAMP4O75379 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
VAMP4O75379 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
VAMP4O75379 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
VAMP4O75379 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
VAMP4O75379 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
VAMP4O75379 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
VAMP4O75379 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
VAMP4O75379 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
VAMP4O75379 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
VAMP4O75379 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
VAMP4O75379 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
VAMP4O75379 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
VAMP4O75379 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
VAMP4O75379 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
VAMP4O75379 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
VAMP4O75379 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
VAMP4O75379 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
VAMP4O75379 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
VAMP4O75379 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
VAMP4O75379 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
VAMP4O75379 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
VAMP4O75379 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
VAMP4O75379 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
VAMP4O75379 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
VAMP4O75379 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
VAMP4O75379 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
VAMP4O75379 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms