Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPFIA3O75145 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPFIA3O75145 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPFIA3O75145 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPFIA3O75145 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPFIA3O75145 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPFIA3O75145 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPFIA3O75145 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPFIA3O75145 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPFIA3O75145 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPFIA3O75145 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPFIA3O75145 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPFIA3O75145 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPFIA3O75145 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPFIA3O75145 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPFIA3O75145 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPFIA3O75145 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PPFIA3O75145 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPFIA3O75145 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPFIA3O75145 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPFIA3O75145 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPFIA3O75145 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPFIA3O75145 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPFIA3O75145 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPFIA3O75145 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPFIA3O75145 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPFIA3O75145 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPFIA3O75145 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPFIA3O75145 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPFIA3O75145 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PPFIA3O75145 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PPFIA3O75145 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PPFIA3O75145 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPFIA3O75145 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPFIA3O75145 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPFIA3O75145 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPFIA3O75145 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPFIA3O75145 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPFIA3O75145 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PPFIA3O75145 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPFIA3O75145 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPFIA3O75145 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPFIA3O75145 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPFIA3O75145 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPFIA3O75145 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPFIA3O75145 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPFIA3O75145 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPFIA3O75145 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPFIA3O75145 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPFIA3O75145 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPFIA3O75145 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPFIA3O75145 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPFIA3O75145 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPFIA3O75145 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PPFIA3O75145 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPFIA3O75145 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPFIA3O75145 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPFIA3O75145 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPFIA3O75145 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPFIA3O75145 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPFIA3O75145 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPFIA3O75145 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPFIA3O75145 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPFIA3O75145 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPFIA3O75145 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPFIA3O75145 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPFIA3O75145 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPFIA3O75145 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPFIA3O75145 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPFIA3O75145 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PPFIA3O75145 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPFIA3O75145 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPFIA3O75145 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PPFIA3O75145 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PPFIA3O75145 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPFIA3O75145 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPFIA3O75145 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPFIA3O75145 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPFIA3O75145 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPFIA3O75145 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PPFIA3O75145 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPFIA3O75145 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPFIA3O75145 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPFIA3O75145 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPFIA3O75145 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPFIA3O75145 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPFIA3O75145 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPFIA3O75145 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPFIA3O75145 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPFIA3O75145 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPFIA3O75145 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPFIA3O75145 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPFIA3O75145 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPFIA3O75145 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPFIA3O75145 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPFIA3O75145 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPFIA3O75145 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPFIA3O75145 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPFIA3O75145 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPFIA3O75145 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms