Protein–RNA interactions for Protein: O60613

SELENOF, Selenoprotein F, humanhuman

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENOFO60613 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SELENOFO60613 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SELENOFO60613 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SELENOFO60613 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SELENOFO60613 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SELENOFO60613 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SELENOFO60613 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SELENOFO60613 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SELENOFO60613 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SELENOFO60613 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SELENOFO60613 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SELENOFO60613 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SELENOFO60613 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SELENOFO60613 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SELENOFO60613 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SELENOFO60613 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SELENOFO60613 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SELENOFO60613 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SELENOFO60613 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SELENOFO60613 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SELENOFO60613 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SELENOFO60613 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SELENOFO60613 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SELENOFO60613 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SELENOFO60613 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SELENOFO60613 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SELENOFO60613 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SELENOFO60613 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SELENOFO60613 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SELENOFO60613 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SELENOFO60613 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SELENOFO60613 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SELENOFO60613 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SELENOFO60613 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SELENOFO60613 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SELENOFO60613 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SELENOFO60613 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SELENOFO60613 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SELENOFO60613 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SELENOFO60613 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SELENOFO60613 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SELENOFO60613 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SELENOFO60613 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SELENOFO60613 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SELENOFO60613 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SELENOFO60613 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SELENOFO60613 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SELENOFO60613 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SELENOFO60613 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SELENOFO60613 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SELENOFO60613 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SELENOFO60613 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SELENOFO60613 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SELENOFO60613 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SELENOFO60613 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SELENOFO60613 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SELENOFO60613 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SELENOFO60613 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SELENOFO60613 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SELENOFO60613 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SELENOFO60613 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SELENOFO60613 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SELENOFO60613 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SELENOFO60613 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SELENOFO60613 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SELENOFO60613 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SELENOFO60613 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SELENOFO60613 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SELENOFO60613 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SELENOFO60613 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SELENOFO60613 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SELENOFO60613 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SELENOFO60613 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SELENOFO60613 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SELENOFO60613 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SELENOFO60613 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SELENOFO60613 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SELENOFO60613 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SELENOFO60613 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SELENOFO60613 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SELENOFO60613 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SELENOFO60613 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SELENOFO60613 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SELENOFO60613 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SELENOFO60613 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SELENOFO60613 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SELENOFO60613 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SELENOFO60613 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SELENOFO60613 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SELENOFO60613 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SELENOFO60613 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SELENOFO60613 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SELENOFO60613 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SELENOFO60613 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SELENOFO60613 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SELENOFO60613 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SELENOFO60613 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SELENOFO60613 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SELENOFO60613 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SELENOFO60613 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms