Protein–RNA interactions for Protein: O60296

TRAK2, Trafficking kinesin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK2O60296 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAK2O60296 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAK2O60296 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAK2O60296 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAK2O60296 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAK2O60296 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAK2O60296 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAK2O60296 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAK2O60296 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAK2O60296 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAK2O60296 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAK2O60296 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAK2O60296 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAK2O60296 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAK2O60296 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAK2O60296 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAK2O60296 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAK2O60296 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAK2O60296 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAK2O60296 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAK2O60296 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAK2O60296 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAK2O60296 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAK2O60296 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAK2O60296 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAK2O60296 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAK2O60296 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAK2O60296 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAK2O60296 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAK2O60296 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAK2O60296 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAK2O60296 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAK2O60296 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAK2O60296 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAK2O60296 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAK2O60296 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAK2O60296 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAK2O60296 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAK2O60296 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAK2O60296 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAK2O60296 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAK2O60296 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAK2O60296 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAK2O60296 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAK2O60296 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAK2O60296 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAK2O60296 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAK2O60296 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAK2O60296 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAK2O60296 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAK2O60296 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAK2O60296 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAK2O60296 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAK2O60296 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAK2O60296 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAK2O60296 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAK2O60296 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAK2O60296 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAK2O60296 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAK2O60296 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAK2O60296 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAK2O60296 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAK2O60296 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAK2O60296 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAK2O60296 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAK2O60296 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAK2O60296 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAK2O60296 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAK2O60296 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAK2O60296 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAK2O60296 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAK2O60296 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAK2O60296 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAK2O60296 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAK2O60296 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAK2O60296 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAK2O60296 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAK2O60296 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAK2O60296 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAK2O60296 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAK2O60296 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAK2O60296 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAK2O60296 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAK2O60296 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAK2O60296 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAK2O60296 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAK2O60296 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAK2O60296 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAK2O60296 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAK2O60296 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAK2O60296 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAK2O60296 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAK2O60296 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAK2O60296 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAK2O60296 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAK2O60296 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAK2O60296 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAK2O60296 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAK2O60296 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAK2O60296 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms