Protein–RNA interactions for Protein: O43927

CXCL13, C-X-C motif chemokine 13, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL13O43927 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CXCL13O43927 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CXCL13O43927 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CXCL13O43927 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CXCL13O43927 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CXCL13O43927 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CXCL13O43927 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CXCL13O43927 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CXCL13O43927 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CXCL13O43927 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CXCL13O43927 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CXCL13O43927 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CXCL13O43927 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CXCL13O43927 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CXCL13O43927 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CXCL13O43927 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CXCL13O43927 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CXCL13O43927 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CXCL13O43927 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CXCL13O43927 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CXCL13O43927 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CXCL13O43927 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CXCL13O43927 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CXCL13O43927 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CXCL13O43927 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CXCL13O43927 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CXCL13O43927 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CXCL13O43927 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CXCL13O43927 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CXCL13O43927 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CXCL13O43927 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CXCL13O43927 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CXCL13O43927 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CXCL13O43927 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CXCL13O43927 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CXCL13O43927 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CXCL13O43927 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CXCL13O43927 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CXCL13O43927 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CXCL13O43927 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CXCL13O43927 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CXCL13O43927 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CXCL13O43927 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CXCL13O43927 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CXCL13O43927 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CXCL13O43927 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CXCL13O43927 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CXCL13O43927 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CXCL13O43927 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CXCL13O43927 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CXCL13O43927 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CXCL13O43927 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CXCL13O43927 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CXCL13O43927 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CXCL13O43927 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CXCL13O43927 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CXCL13O43927 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CXCL13O43927 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CXCL13O43927 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CXCL13O43927 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CXCL13O43927 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CXCL13O43927 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CXCL13O43927 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CXCL13O43927 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CXCL13O43927 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CXCL13O43927 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CXCL13O43927 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CXCL13O43927 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CXCL13O43927 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CXCL13O43927 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CXCL13O43927 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CXCL13O43927 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CXCL13O43927 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CXCL13O43927 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CXCL13O43927 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CXCL13O43927 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CXCL13O43927 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CXCL13O43927 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CXCL13O43927 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CXCL13O43927 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CXCL13O43927 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CXCL13O43927 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CXCL13O43927 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CXCL13O43927 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CXCL13O43927 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CXCL13O43927 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CXCL13O43927 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CXCL13O43927 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CXCL13O43927 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CXCL13O43927 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CXCL13O43927 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CXCL13O43927 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CXCL13O43927 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CXCL13O43927 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CXCL13O43927 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CXCL13O43927 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CXCL13O43927 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CXCL13O43927 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CXCL13O43927 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CXCL13O43927 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms