Protein–RNA interactions for Protein: O43909

EXTL3, Exostosin-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL3O43909 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EXTL3O43909 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EXTL3O43909 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EXTL3O43909 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
EXTL3O43909 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EXTL3O43909 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EXTL3O43909 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EXTL3O43909 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EXTL3O43909 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EXTL3O43909 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EXTL3O43909 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EXTL3O43909 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EXTL3O43909 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22■■□□□ 1.11
EXTL3O43909 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EXTL3O43909 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EXTL3O43909 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EXTL3O43909 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EXTL3O43909 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
EXTL3O43909 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
EXTL3O43909 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
EXTL3O43909 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
EXTL3O43909 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
EXTL3O43909 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22■■□□□ 1.11
EXTL3O43909 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EXTL3O43909 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EXTL3O43909 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EXTL3O43909 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
EXTL3O43909 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EXTL3O43909 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EXTL3O43909 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EXTL3O43909 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EXTL3O43909 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EXTL3O43909 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EXTL3O43909 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EXTL3O43909 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EXTL3O43909 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EXTL3O43909 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EXTL3O43909 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EXTL3O43909 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EXTL3O43909 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EXTL3O43909 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EXTL3O43909 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EXTL3O43909 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EXTL3O43909 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EXTL3O43909 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EXTL3O43909 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EXTL3O43909 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EXTL3O43909 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EXTL3O43909 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EXTL3O43909 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EXTL3O43909 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EXTL3O43909 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EXTL3O43909 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EXTL3O43909 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EXTL3O43909 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EXTL3O43909 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EXTL3O43909 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EXTL3O43909 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EXTL3O43909 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EXTL3O43909 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EXTL3O43909 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EXTL3O43909 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EXTL3O43909 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EXTL3O43909 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EXTL3O43909 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EXTL3O43909 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EXTL3O43909 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EXTL3O43909 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EXTL3O43909 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EXTL3O43909 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EXTL3O43909 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EXTL3O43909 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EXTL3O43909 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EXTL3O43909 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EXTL3O43909 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EXTL3O43909 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
EXTL3O43909 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EXTL3O43909 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EXTL3O43909 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EXTL3O43909 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EXTL3O43909 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
EXTL3O43909 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EXTL3O43909 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EXTL3O43909 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EXTL3O43909 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EXTL3O43909 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EXTL3O43909 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EXTL3O43909 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EXTL3O43909 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EXTL3O43909 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EXTL3O43909 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EXTL3O43909 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EXTL3O43909 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EXTL3O43909 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EXTL3O43909 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EXTL3O43909 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EXTL3O43909 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EXTL3O43909 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EXTL3O43909 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EXTL3O43909 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms