Protein–RNA interactions for Protein: O43719

HTATSF1, HIV Tat-specific factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1O43719 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HTATSF1O43719 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HTATSF1O43719 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HTATSF1O43719 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HTATSF1O43719 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HTATSF1O43719 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HTATSF1O43719 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HTATSF1O43719 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HTATSF1O43719 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HTATSF1O43719 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HTATSF1O43719 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
HTATSF1O43719 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HTATSF1O43719 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HTATSF1O43719 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HTATSF1O43719 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HTATSF1O43719 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HTATSF1O43719 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HTATSF1O43719 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HTATSF1O43719 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HTATSF1O43719 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HTATSF1O43719 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
HTATSF1O43719 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HTATSF1O43719 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HTATSF1O43719 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HTATSF1O43719 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HTATSF1O43719 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HTATSF1O43719 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HTATSF1O43719 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HTATSF1O43719 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HTATSF1O43719 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HTATSF1O43719 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
HTATSF1O43719 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
HTATSF1O43719 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HTATSF1O43719 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HTATSF1O43719 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HTATSF1O43719 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HTATSF1O43719 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HTATSF1O43719 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HTATSF1O43719 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HTATSF1O43719 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HTATSF1O43719 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HTATSF1O43719 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HTATSF1O43719 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HTATSF1O43719 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HTATSF1O43719 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HTATSF1O43719 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HTATSF1O43719 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HTATSF1O43719 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HTATSF1O43719 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HTATSF1O43719 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HTATSF1O43719 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HTATSF1O43719 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HTATSF1O43719 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HTATSF1O43719 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HTATSF1O43719 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HTATSF1O43719 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HTATSF1O43719 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HTATSF1O43719 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HTATSF1O43719 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HTATSF1O43719 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HTATSF1O43719 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
HTATSF1O43719 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HTATSF1O43719 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HTATSF1O43719 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HTATSF1O43719 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HTATSF1O43719 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HTATSF1O43719 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
HTATSF1O43719 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
HTATSF1O43719 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HTATSF1O43719 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HTATSF1O43719 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HTATSF1O43719 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
HTATSF1O43719 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HTATSF1O43719 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HTATSF1O43719 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
HTATSF1O43719 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HTATSF1O43719 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
HTATSF1O43719 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HTATSF1O43719 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HTATSF1O43719 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HTATSF1O43719 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HTATSF1O43719 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HTATSF1O43719 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HTATSF1O43719 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HTATSF1O43719 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HTATSF1O43719 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HTATSF1O43719 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HTATSF1O43719 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HTATSF1O43719 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HTATSF1O43719 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HTATSF1O43719 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HTATSF1O43719 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HTATSF1O43719 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HTATSF1O43719 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HTATSF1O43719 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HTATSF1O43719 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HTATSF1O43719 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HTATSF1O43719 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HTATSF1O43719 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HTATSF1O43719 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms