Protein–RNA interactions for Protein: O15399

GRIN2D, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2D, humanhuman

Predictions only

Length 1,336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2DO15399 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIN2DO15399 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIN2DO15399 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIN2DO15399 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIN2DO15399 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIN2DO15399 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIN2DO15399 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIN2DO15399 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIN2DO15399 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIN2DO15399 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIN2DO15399 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIN2DO15399 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIN2DO15399 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIN2DO15399 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIN2DO15399 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIN2DO15399 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIN2DO15399 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIN2DO15399 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIN2DO15399 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIN2DO15399 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIN2DO15399 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIN2DO15399 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIN2DO15399 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIN2DO15399 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIN2DO15399 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIN2DO15399 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIN2DO15399 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIN2DO15399 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIN2DO15399 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIN2DO15399 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIN2DO15399 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIN2DO15399 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIN2DO15399 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIN2DO15399 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIN2DO15399 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIN2DO15399 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIN2DO15399 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIN2DO15399 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIN2DO15399 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIN2DO15399 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIN2DO15399 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIN2DO15399 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIN2DO15399 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIN2DO15399 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIN2DO15399 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIN2DO15399 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIN2DO15399 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIN2DO15399 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIN2DO15399 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIN2DO15399 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIN2DO15399 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIN2DO15399 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIN2DO15399 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIN2DO15399 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIN2DO15399 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIN2DO15399 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIN2DO15399 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIN2DO15399 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIN2DO15399 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIN2DO15399 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIN2DO15399 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIN2DO15399 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIN2DO15399 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIN2DO15399 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIN2DO15399 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIN2DO15399 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIN2DO15399 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIN2DO15399 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIN2DO15399 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIN2DO15399 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIN2DO15399 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIN2DO15399 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIN2DO15399 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIN2DO15399 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIN2DO15399 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIN2DO15399 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIN2DO15399 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIN2DO15399 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIN2DO15399 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIN2DO15399 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIN2DO15399 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIN2DO15399 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIN2DO15399 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIN2DO15399 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIN2DO15399 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIN2DO15399 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIN2DO15399 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIN2DO15399 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIN2DO15399 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIN2DO15399 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIN2DO15399 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIN2DO15399 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIN2DO15399 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIN2DO15399 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIN2DO15399 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIN2DO15399 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIN2DO15399 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIN2DO15399 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIN2DO15399 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIN2DO15399 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms