Protein–RNA interactions for Protein: O15353

FOXN1, Forkhead box protein N1, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXN1O15353 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOXN1O15353 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOXN1O15353 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOXN1O15353 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOXN1O15353 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOXN1O15353 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOXN1O15353 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
FOXN1O15353 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
FOXN1O15353 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
FOXN1O15353 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXN1O15353 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXN1O15353 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXN1O15353 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXN1O15353 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXN1O15353 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXN1O15353 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXN1O15353 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXN1O15353 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXN1O15353 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXN1O15353 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXN1O15353 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXN1O15353 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXN1O15353 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXN1O15353 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXN1O15353 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXN1O15353 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXN1O15353 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXN1O15353 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXN1O15353 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXN1O15353 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXN1O15353 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXN1O15353 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXN1O15353 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXN1O15353 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXN1O15353 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXN1O15353 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXN1O15353 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXN1O15353 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXN1O15353 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXN1O15353 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXN1O15353 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXN1O15353 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXN1O15353 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXN1O15353 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXN1O15353 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXN1O15353 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXN1O15353 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXN1O15353 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXN1O15353 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXN1O15353 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXN1O15353 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXN1O15353 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXN1O15353 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOXN1O15353 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOXN1O15353 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOXN1O15353 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOXN1O15353 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOXN1O15353 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOXN1O15353 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOXN1O15353 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOXN1O15353 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOXN1O15353 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOXN1O15353 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOXN1O15353 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOXN1O15353 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOXN1O15353 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOXN1O15353 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOXN1O15353 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOXN1O15353 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOXN1O15353 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOXN1O15353 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOXN1O15353 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOXN1O15353 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOXN1O15353 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOXN1O15353 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOXN1O15353 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOXN1O15353 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOXN1O15353 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOXN1O15353 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOXN1O15353 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOXN1O15353 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOXN1O15353 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOXN1O15353 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOXN1O15353 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOXN1O15353 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOXN1O15353 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOXN1O15353 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOXN1O15353 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOXN1O15353 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOXN1O15353 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOXN1O15353 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOXN1O15353 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOXN1O15353 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOXN1O15353 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOXN1O15353 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOXN1O15353 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOXN1O15353 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOXN1O15353 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOXN1O15353 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FOXN1O15353 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms