Protein–RNA interactions for Protein: O15084

ANKRD28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28O15084 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ANKRD28O15084 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ANKRD28O15084 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ANKRD28O15084 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ANKRD28O15084 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ANKRD28O15084 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ANKRD28O15084 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ANKRD28O15084 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ANKRD28O15084 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ANKRD28O15084 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ANKRD28O15084 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ANKRD28O15084 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ANKRD28O15084 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ANKRD28O15084 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ANKRD28O15084 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ANKRD28O15084 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ANKRD28O15084 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ANKRD28O15084 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ANKRD28O15084 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ANKRD28O15084 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ANKRD28O15084 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ANKRD28O15084 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ANKRD28O15084 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ANKRD28O15084 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ANKRD28O15084 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ANKRD28O15084 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ANKRD28O15084 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ANKRD28O15084 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ANKRD28O15084 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ANKRD28O15084 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ANKRD28O15084 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ANKRD28O15084 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ANKRD28O15084 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ANKRD28O15084 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ANKRD28O15084 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ANKRD28O15084 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ANKRD28O15084 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ANKRD28O15084 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ANKRD28O15084 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ANKRD28O15084 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ANKRD28O15084 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ANKRD28O15084 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ANKRD28O15084 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ANKRD28O15084 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ANKRD28O15084 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ANKRD28O15084 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ANKRD28O15084 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ANKRD28O15084 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ANKRD28O15084 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ANKRD28O15084 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ANKRD28O15084 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ANKRD28O15084 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ANKRD28O15084 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ANKRD28O15084 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ANKRD28O15084 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ANKRD28O15084 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ANKRD28O15084 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ANKRD28O15084 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ANKRD28O15084 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ANKRD28O15084 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ANKRD28O15084 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ANKRD28O15084 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ANKRD28O15084 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ANKRD28O15084 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ANKRD28O15084 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ANKRD28O15084 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ANKRD28O15084 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ANKRD28O15084 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ANKRD28O15084 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ANKRD28O15084 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ANKRD28O15084 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ANKRD28O15084 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ANKRD28O15084 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ANKRD28O15084 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ANKRD28O15084 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ANKRD28O15084 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ANKRD28O15084 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ANKRD28O15084 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ANKRD28O15084 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ANKRD28O15084 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ANKRD28O15084 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ANKRD28O15084 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ANKRD28O15084 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ANKRD28O15084 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ANKRD28O15084 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ANKRD28O15084 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ANKRD28O15084 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ANKRD28O15084 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
ANKRD28O15084 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ANKRD28O15084 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ANKRD28O15084 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ANKRD28O15084 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ANKRD28O15084 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ANKRD28O15084 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
ANKRD28O15084 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ANKRD28O15084 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ANKRD28O15084 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ANKRD28O15084 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ANKRD28O15084 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ANKRD28O15084 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms