Protein–RNA interactions for Protein: O14503

BHLHE40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE40O14503 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BHLHE40O14503 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
BHLHE40O14503 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BHLHE40O14503 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BHLHE40O14503 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BHLHE40O14503 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BHLHE40O14503 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHLHE40O14503 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHLHE40O14503 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHLHE40O14503 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHLHE40O14503 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHLHE40O14503 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHLHE40O14503 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHLHE40O14503 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHLHE40O14503 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHLHE40O14503 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHLHE40O14503 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHLHE40O14503 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHLHE40O14503 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHLHE40O14503 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHLHE40O14503 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHLHE40O14503 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHLHE40O14503 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
BHLHE40O14503 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHLHE40O14503 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHLHE40O14503 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHLHE40O14503 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHLHE40O14503 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHLHE40O14503 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHLHE40O14503 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHLHE40O14503 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHLHE40O14503 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
BHLHE40O14503 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHLHE40O14503 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHLHE40O14503 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHLHE40O14503 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHLHE40O14503 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHLHE40O14503 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHLHE40O14503 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHLHE40O14503 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHLHE40O14503 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHLHE40O14503 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHLHE40O14503 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHLHE40O14503 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHLHE40O14503 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHLHE40O14503 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHLHE40O14503 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHLHE40O14503 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHLHE40O14503 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHLHE40O14503 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHLHE40O14503 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BHLHE40O14503 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BHLHE40O14503 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BHLHE40O14503 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BHLHE40O14503 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BHLHE40O14503 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BHLHE40O14503 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BHLHE40O14503 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BHLHE40O14503 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
BHLHE40O14503 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BHLHE40O14503 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BHLHE40O14503 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
BHLHE40O14503 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BHLHE40O14503 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BHLHE40O14503 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BHLHE40O14503 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BHLHE40O14503 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BHLHE40O14503 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BHLHE40O14503 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BHLHE40O14503 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BHLHE40O14503 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BHLHE40O14503 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
BHLHE40O14503 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BHLHE40O14503 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BHLHE40O14503 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BHLHE40O14503 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BHLHE40O14503 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BHLHE40O14503 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BHLHE40O14503 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BHLHE40O14503 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BHLHE40O14503 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BHLHE40O14503 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BHLHE40O14503 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BHLHE40O14503 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BHLHE40O14503 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BHLHE40O14503 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BHLHE40O14503 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BHLHE40O14503 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BHLHE40O14503 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BHLHE40O14503 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BHLHE40O14503 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BHLHE40O14503 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BHLHE40O14503 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BHLHE40O14503 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BHLHE40O14503 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BHLHE40O14503 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BHLHE40O14503 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHLHE40O14503 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHLHE40O14503 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHLHE40O14503 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms