Protein–RNA interactions for Protein: J3KT08

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KT08 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
J3KT08 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
J3KT08 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
J3KT08 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
J3KT08 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
J3KT08 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
J3KT08 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
J3KT08 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
J3KT08 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
J3KT08 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
J3KT08 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
J3KT08 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
J3KT08 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
J3KT08 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
J3KT08 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
J3KT08 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
J3KT08 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
J3KT08 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
J3KT08 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
J3KT08 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
J3KT08 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
J3KT08 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
J3KT08 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
J3KT08 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
J3KT08 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
J3KT08 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
J3KT08 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
J3KT08 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
J3KT08 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
J3KT08 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
J3KT08 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
J3KT08 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
J3KT08 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
J3KT08 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
J3KT08 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
J3KT08 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
J3KT08 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
J3KT08 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
J3KT08 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
J3KT08 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
J3KT08 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
J3KT08 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
J3KT08 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
J3KT08 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
J3KT08 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
J3KT08 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
J3KT08 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
J3KT08 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
J3KT08 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
J3KT08 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
J3KT08 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
J3KT08 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
J3KT08 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
J3KT08 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
J3KT08 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
J3KT08 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
J3KT08 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
J3KT08 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
J3KT08 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
J3KT08 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
J3KT08 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
J3KT08 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
J3KT08 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
J3KT08 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
J3KT08 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
J3KT08 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
J3KT08 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
J3KT08 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
J3KT08 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
J3KT08 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
J3KT08 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
J3KT08 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
J3KT08 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
J3KT08 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
J3KT08 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
J3KT08 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
J3KT08 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
J3KT08 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
J3KT08 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
J3KT08 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
J3KT08 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
J3KT08 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
J3KT08 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
J3KT08 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
J3KT08 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
J3KT08 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
J3KT08 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
J3KT08 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
J3KT08 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
J3KT08 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
J3KT08 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
J3KT08 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
J3KT08 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
J3KT08 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
J3KT08 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
J3KT08 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
J3KT08 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
J3KT08 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
J3KT08 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
J3KT08 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms