Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC01387J3KSC0 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC01387J3KSC0 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC01387J3KSC0 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC01387J3KSC0 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC01387J3KSC0 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC01387J3KSC0 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC01387J3KSC0 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC01387J3KSC0 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC01387J3KSC0 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC01387J3KSC0 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC01387J3KSC0 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC01387J3KSC0 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC01387J3KSC0 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC01387J3KSC0 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC01387J3KSC0 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC01387J3KSC0 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC01387J3KSC0 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC01387J3KSC0 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC01387J3KSC0 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC01387J3KSC0 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC01387J3KSC0 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC01387J3KSC0 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC01387J3KSC0 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC01387J3KSC0 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC01387J3KSC0 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC01387J3KSC0 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC01387J3KSC0 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC01387J3KSC0 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC01387J3KSC0 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC01387J3KSC0 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC01387J3KSC0 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC01387J3KSC0 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC01387J3KSC0 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC01387J3KSC0 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC01387J3KSC0 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC01387J3KSC0 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC01387J3KSC0 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC01387J3KSC0 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC01387J3KSC0 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC01387J3KSC0 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC01387J3KSC0 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC01387J3KSC0 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC01387J3KSC0 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC01387J3KSC0 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC01387J3KSC0 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC01387J3KSC0 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC01387J3KSC0 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC01387J3KSC0 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC01387J3KSC0 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC01387J3KSC0 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC01387J3KSC0 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC01387J3KSC0 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC01387J3KSC0 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC01387J3KSC0 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC01387J3KSC0 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC01387J3KSC0 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC01387J3KSC0 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC01387J3KSC0 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC01387J3KSC0 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC01387J3KSC0 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC01387J3KSC0 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC01387J3KSC0 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC01387J3KSC0 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC01387J3KSC0 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC01387J3KSC0 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC01387J3KSC0 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC01387J3KSC0 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC01387J3KSC0 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC01387J3KSC0 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC01387J3KSC0 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC01387J3KSC0 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC01387J3KSC0 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC01387J3KSC0 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC01387J3KSC0 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC01387J3KSC0 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC01387J3KSC0 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC01387J3KSC0 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC01387J3KSC0 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC01387J3KSC0 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC01387J3KSC0 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC01387J3KSC0 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC01387J3KSC0 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC01387J3KSC0 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC01387J3KSC0 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC01387J3KSC0 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC01387J3KSC0 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC01387J3KSC0 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC01387J3KSC0 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC01387J3KSC0 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC01387J3KSC0 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC01387J3KSC0 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC01387J3KSC0 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC01387J3KSC0 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC01387J3KSC0 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC01387J3KSC0 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC01387J3KSC0 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC01387J3KSC0 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC01387J3KSC0 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC01387J3KSC0 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms