Protein–RNA interactions for Protein: I3L3R5

CCER2, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCER2I3L3R5 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCER2I3L3R5 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCER2I3L3R5 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCER2I3L3R5 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCER2I3L3R5 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCER2I3L3R5 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCER2I3L3R5 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCER2I3L3R5 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCER2I3L3R5 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCER2I3L3R5 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCER2I3L3R5 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCER2I3L3R5 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCER2I3L3R5 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCER2I3L3R5 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCER2I3L3R5 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCER2I3L3R5 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCER2I3L3R5 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCER2I3L3R5 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCER2I3L3R5 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCER2I3L3R5 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCER2I3L3R5 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCER2I3L3R5 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCER2I3L3R5 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCER2I3L3R5 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCER2I3L3R5 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCER2I3L3R5 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCER2I3L3R5 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCER2I3L3R5 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCER2I3L3R5 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCER2I3L3R5 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCER2I3L3R5 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCER2I3L3R5 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCER2I3L3R5 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCER2I3L3R5 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CCER2I3L3R5 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCER2I3L3R5 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCER2I3L3R5 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCER2I3L3R5 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCER2I3L3R5 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CCER2I3L3R5 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CCER2I3L3R5 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CCER2I3L3R5 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CCER2I3L3R5 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CCER2I3L3R5 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CCER2I3L3R5 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CCER2I3L3R5 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCER2I3L3R5 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCER2I3L3R5 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCER2I3L3R5 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCER2I3L3R5 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCER2I3L3R5 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCER2I3L3R5 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCER2I3L3R5 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCER2I3L3R5 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCER2I3L3R5 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCER2I3L3R5 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCER2I3L3R5 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCER2I3L3R5 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCER2I3L3R5 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCER2I3L3R5 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCER2I3L3R5 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCER2I3L3R5 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCER2I3L3R5 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCER2I3L3R5 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCER2I3L3R5 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCER2I3L3R5 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCER2I3L3R5 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCER2I3L3R5 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCER2I3L3R5 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCER2I3L3R5 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCER2I3L3R5 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCER2I3L3R5 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCER2I3L3R5 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCER2I3L3R5 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCER2I3L3R5 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCER2I3L3R5 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCER2I3L3R5 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCER2I3L3R5 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCER2I3L3R5 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCER2I3L3R5 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCER2I3L3R5 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCER2I3L3R5 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCER2I3L3R5 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCER2I3L3R5 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CCER2I3L3R5 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCER2I3L3R5 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCER2I3L3R5 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCER2I3L3R5 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCER2I3L3R5 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCER2I3L3R5 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCER2I3L3R5 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCER2I3L3R5 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCER2I3L3R5 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCER2I3L3R5 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCER2I3L3R5 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCER2I3L3R5 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CCER2I3L3R5 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCER2I3L3R5 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCER2I3L3R5 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCER2I3L3R5 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms