Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NEDD8-MDP1E9PL57 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NEDD8-MDP1E9PL57 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NEDD8-MDP1E9PL57 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NEDD8-MDP1E9PL57 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NEDD8-MDP1E9PL57 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NEDD8-MDP1E9PL57 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NEDD8-MDP1E9PL57 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NEDD8-MDP1E9PL57 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NEDD8-MDP1E9PL57 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NEDD8-MDP1E9PL57 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NEDD8-MDP1E9PL57 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NEDD8-MDP1E9PL57 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NEDD8-MDP1E9PL57 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NEDD8-MDP1E9PL57 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NEDD8-MDP1E9PL57 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NEDD8-MDP1E9PL57 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NEDD8-MDP1E9PL57 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NEDD8-MDP1E9PL57 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NEDD8-MDP1E9PL57 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NEDD8-MDP1E9PL57 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NEDD8-MDP1E9PL57 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NEDD8-MDP1E9PL57 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NEDD8-MDP1E9PL57 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NEDD8-MDP1E9PL57 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NEDD8-MDP1E9PL57 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NEDD8-MDP1E9PL57 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NEDD8-MDP1E9PL57 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NEDD8-MDP1E9PL57 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NEDD8-MDP1E9PL57 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NEDD8-MDP1E9PL57 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NEDD8-MDP1E9PL57 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NEDD8-MDP1E9PL57 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NEDD8-MDP1E9PL57 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NEDD8-MDP1E9PL57 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NEDD8-MDP1E9PL57 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NEDD8-MDP1E9PL57 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NEDD8-MDP1E9PL57 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NEDD8-MDP1E9PL57 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NEDD8-MDP1E9PL57 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NEDD8-MDP1E9PL57 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NEDD8-MDP1E9PL57 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NEDD8-MDP1E9PL57 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NEDD8-MDP1E9PL57 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NEDD8-MDP1E9PL57 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NEDD8-MDP1E9PL57 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NEDD8-MDP1E9PL57 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NEDD8-MDP1E9PL57 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NEDD8-MDP1E9PL57 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NEDD8-MDP1E9PL57 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NEDD8-MDP1E9PL57 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
NEDD8-MDP1E9PL57 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NEDD8-MDP1E9PL57 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NEDD8-MDP1E9PL57 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NEDD8-MDP1E9PL57 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NEDD8-MDP1E9PL57 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NEDD8-MDP1E9PL57 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NEDD8-MDP1E9PL57 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
NEDD8-MDP1E9PL57 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NEDD8-MDP1E9PL57 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NEDD8-MDP1E9PL57 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
NEDD8-MDP1E9PL57 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
NEDD8-MDP1E9PL57 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NEDD8-MDP1E9PL57 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NEDD8-MDP1E9PL57 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NEDD8-MDP1E9PL57 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NEDD8-MDP1E9PL57 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NEDD8-MDP1E9PL57 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NEDD8-MDP1E9PL57 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NEDD8-MDP1E9PL57 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NEDD8-MDP1E9PL57 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NEDD8-MDP1E9PL57 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NEDD8-MDP1E9PL57 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NEDD8-MDP1E9PL57 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NEDD8-MDP1E9PL57 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NEDD8-MDP1E9PL57 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NEDD8-MDP1E9PL57 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NEDD8-MDP1E9PL57 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NEDD8-MDP1E9PL57 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NEDD8-MDP1E9PL57 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NEDD8-MDP1E9PL57 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
NEDD8-MDP1E9PL57 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NEDD8-MDP1E9PL57 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NEDD8-MDP1E9PL57 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NEDD8-MDP1E9PL57 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NEDD8-MDP1E9PL57 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NEDD8-MDP1E9PL57 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NEDD8-MDP1E9PL57 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NEDD8-MDP1E9PL57 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NEDD8-MDP1E9PL57 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
NEDD8-MDP1E9PL57 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NEDD8-MDP1E9PL57 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms