Protein–RNA interactions for Protein: C9JLJ4

USP17L13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L13C9JLJ4 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP17L13C9JLJ4 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP17L13C9JLJ4 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP17L13C9JLJ4 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP17L13C9JLJ4 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP17L13C9JLJ4 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP17L13C9JLJ4 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP17L13C9JLJ4 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
USP17L13C9JLJ4 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP17L13C9JLJ4 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP17L13C9JLJ4 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP17L13C9JLJ4 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP17L13C9JLJ4 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
USP17L13C9JLJ4 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
USP17L13C9JLJ4 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP17L13C9JLJ4 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP17L13C9JLJ4 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP17L13C9JLJ4 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP17L13C9JLJ4 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP17L13C9JLJ4 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP17L13C9JLJ4 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
USP17L13C9JLJ4 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP17L13C9JLJ4 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP17L13C9JLJ4 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP17L13C9JLJ4 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
USP17L13C9JLJ4 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP17L13C9JLJ4 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP17L13C9JLJ4 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP17L13C9JLJ4 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP17L13C9JLJ4 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
USP17L13C9JLJ4 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
USP17L13C9JLJ4 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP17L13C9JLJ4 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP17L13C9JLJ4 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP17L13C9JLJ4 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP17L13C9JLJ4 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP17L13C9JLJ4 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP17L13C9JLJ4 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP17L13C9JLJ4 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP17L13C9JLJ4 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP17L13C9JLJ4 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP17L13C9JLJ4 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP17L13C9JLJ4 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP17L13C9JLJ4 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP17L13C9JLJ4 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP17L13C9JLJ4 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP17L13C9JLJ4 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP17L13C9JLJ4 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP17L13C9JLJ4 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP17L13C9JLJ4 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP17L13C9JLJ4 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP17L13C9JLJ4 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP17L13C9JLJ4 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP17L13C9JLJ4 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP17L13C9JLJ4 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP17L13C9JLJ4 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP17L13C9JLJ4 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP17L13C9JLJ4 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP17L13C9JLJ4 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP17L13C9JLJ4 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP17L13C9JLJ4 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP17L13C9JLJ4 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP17L13C9JLJ4 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP17L13C9JLJ4 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP17L13C9JLJ4 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP17L13C9JLJ4 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP17L13C9JLJ4 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP17L13C9JLJ4 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
USP17L13C9JLJ4 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP17L13C9JLJ4 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP17L13C9JLJ4 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP17L13C9JLJ4 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP17L13C9JLJ4 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
USP17L13C9JLJ4 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
USP17L13C9JLJ4 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP17L13C9JLJ4 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP17L13C9JLJ4 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP17L13C9JLJ4 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP17L13C9JLJ4 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP17L13C9JLJ4 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP17L13C9JLJ4 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP17L13C9JLJ4 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP17L13C9JLJ4 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
USP17L13C9JLJ4 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP17L13C9JLJ4 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP17L13C9JLJ4 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP17L13C9JLJ4 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP17L13C9JLJ4 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP17L13C9JLJ4 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP17L13C9JLJ4 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP17L13C9JLJ4 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP17L13C9JLJ4 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP17L13C9JLJ4 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP17L13C9JLJ4 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP17L13C9JLJ4 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP17L13C9JLJ4 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP17L13C9JLJ4 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP17L13C9JLJ4 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP17L13C9JLJ4 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP17L13C9JLJ4 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms