Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ERVV-1B6SEH8 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ERVV-1B6SEH8 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ERVV-1B6SEH8 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ERVV-1B6SEH8 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ERVV-1B6SEH8 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ERVV-1B6SEH8 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ERVV-1B6SEH8 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ERVV-1B6SEH8 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ERVV-1B6SEH8 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ERVV-1B6SEH8 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ERVV-1B6SEH8 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ERVV-1B6SEH8 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ERVV-1B6SEH8 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ERVV-1B6SEH8 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ERVV-1B6SEH8 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ERVV-1B6SEH8 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ERVV-1B6SEH8 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ERVV-1B6SEH8 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ERVV-1B6SEH8 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ERVV-1B6SEH8 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
ERVV-1B6SEH8 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ERVV-1B6SEH8 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ERVV-1B6SEH8 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ERVV-1B6SEH8 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ERVV-1B6SEH8 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ERVV-1B6SEH8 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ERVV-1B6SEH8 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ERVV-1B6SEH8 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ERVV-1B6SEH8 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ERVV-1B6SEH8 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ERVV-1B6SEH8 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ERVV-1B6SEH8 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ERVV-1B6SEH8 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ERVV-1B6SEH8 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ERVV-1B6SEH8 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ERVV-1B6SEH8 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ERVV-1B6SEH8 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ERVV-1B6SEH8 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ERVV-1B6SEH8 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
ERVV-1B6SEH8 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ERVV-1B6SEH8 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ERVV-1B6SEH8 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ERVV-1B6SEH8 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ERVV-1B6SEH8 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ERVV-1B6SEH8 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ERVV-1B6SEH8 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ERVV-1B6SEH8 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ERVV-1B6SEH8 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ERVV-1B6SEH8 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ERVV-1B6SEH8 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ERVV-1B6SEH8 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ERVV-1B6SEH8 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ERVV-1B6SEH8 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ERVV-1B6SEH8 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
ERVV-1B6SEH8 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ERVV-1B6SEH8 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ERVV-1B6SEH8 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ERVV-1B6SEH8 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ERVV-1B6SEH8 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ERVV-1B6SEH8 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ERVV-1B6SEH8 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ERVV-1B6SEH8 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ERVV-1B6SEH8 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ERVV-1B6SEH8 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ERVV-1B6SEH8 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ERVV-1B6SEH8 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ERVV-1B6SEH8 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
ERVV-1B6SEH8 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ERVV-1B6SEH8 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ERVV-1B6SEH8 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
ERVV-1B6SEH8 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ERVV-1B6SEH8 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERVV-1B6SEH8 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERVV-1B6SEH8 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERVV-1B6SEH8 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERVV-1B6SEH8 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERVV-1B6SEH8 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERVV-1B6SEH8 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERVV-1B6SEH8 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERVV-1B6SEH8 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERVV-1B6SEH8 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERVV-1B6SEH8 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERVV-1B6SEH8 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERVV-1B6SEH8 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERVV-1B6SEH8 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
ERVV-1B6SEH8 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERVV-1B6SEH8 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
ERVV-1B6SEH8 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ERVV-1B6SEH8 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ERVV-1B6SEH8 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ERVV-1B6SEH8 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ERVV-1B6SEH8 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ERVV-1B6SEH8 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ERVV-1B6SEH8 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ERVV-1B6SEH8 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ERVV-1B6SEH8 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ERVV-1B6SEH8 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ERVV-1B6SEH8 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ERVV-1B6SEH8 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms