Protein–RNA interactions for Protein: A8MRT5

NPIPB5, Nuclear pore complex-interacting protein family member B5, humanhuman

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB5A8MRT5 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPIPB5A8MRT5 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPIPB5A8MRT5 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPIPB5A8MRT5 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPIPB5A8MRT5 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPIPB5A8MRT5 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPIPB5A8MRT5 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPIPB5A8MRT5 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPIPB5A8MRT5 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPIPB5A8MRT5 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPIPB5A8MRT5 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPIPB5A8MRT5 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPIPB5A8MRT5 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPIPB5A8MRT5 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPIPB5A8MRT5 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPIPB5A8MRT5 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPIPB5A8MRT5 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPIPB5A8MRT5 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPIPB5A8MRT5 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPIPB5A8MRT5 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPIPB5A8MRT5 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPIPB5A8MRT5 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPIPB5A8MRT5 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NPIPB5A8MRT5 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPIPB5A8MRT5 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPIPB5A8MRT5 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPIPB5A8MRT5 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPIPB5A8MRT5 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPIPB5A8MRT5 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPIPB5A8MRT5 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPIPB5A8MRT5 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPIPB5A8MRT5 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPIPB5A8MRT5 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPIPB5A8MRT5 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPIPB5A8MRT5 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPIPB5A8MRT5 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPIPB5A8MRT5 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPIPB5A8MRT5 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPIPB5A8MRT5 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPIPB5A8MRT5 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPIPB5A8MRT5 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPIPB5A8MRT5 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPIPB5A8MRT5 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPIPB5A8MRT5 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPIPB5A8MRT5 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPIPB5A8MRT5 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPIPB5A8MRT5 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPIPB5A8MRT5 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPIPB5A8MRT5 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPIPB5A8MRT5 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPIPB5A8MRT5 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPIPB5A8MRT5 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPIPB5A8MRT5 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NPIPB5A8MRT5 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NPIPB5A8MRT5 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPIPB5A8MRT5 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPIPB5A8MRT5 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPIPB5A8MRT5 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPIPB5A8MRT5 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPIPB5A8MRT5 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPIPB5A8MRT5 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NPIPB5A8MRT5 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPIPB5A8MRT5 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPIPB5A8MRT5 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPIPB5A8MRT5 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPIPB5A8MRT5 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPIPB5A8MRT5 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPIPB5A8MRT5 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPIPB5A8MRT5 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPIPB5A8MRT5 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPIPB5A8MRT5 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPIPB5A8MRT5 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPIPB5A8MRT5 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPIPB5A8MRT5 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPIPB5A8MRT5 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPIPB5A8MRT5 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPIPB5A8MRT5 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPIPB5A8MRT5 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPIPB5A8MRT5 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPIPB5A8MRT5 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPIPB5A8MRT5 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPIPB5A8MRT5 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPIPB5A8MRT5 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPIPB5A8MRT5 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NPIPB5A8MRT5 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPIPB5A8MRT5 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPIPB5A8MRT5 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPIPB5A8MRT5 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NPIPB5A8MRT5 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPIPB5A8MRT5 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPIPB5A8MRT5 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPIPB5A8MRT5 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPIPB5A8MRT5 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPIPB5A8MRT5 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPIPB5A8MRT5 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPIPB5A8MRT5 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NPIPB5A8MRT5 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NPIPB5A8MRT5 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NPIPB5A8MRT5 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NPIPB5A8MRT5 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms