Protein–RNA interactions for Protein: A6NK53

ZNF233, Zinc finger protein 233, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF233A6NK53 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF233A6NK53 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF233A6NK53 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF233A6NK53 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF233A6NK53 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF233A6NK53 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF233A6NK53 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF233A6NK53 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF233A6NK53 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF233A6NK53 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF233A6NK53 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF233A6NK53 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF233A6NK53 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF233A6NK53 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF233A6NK53 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF233A6NK53 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF233A6NK53 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF233A6NK53 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF233A6NK53 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF233A6NK53 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF233A6NK53 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF233A6NK53 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF233A6NK53 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF233A6NK53 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF233A6NK53 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF233A6NK53 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF233A6NK53 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF233A6NK53 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF233A6NK53 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF233A6NK53 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF233A6NK53 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF233A6NK53 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF233A6NK53 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF233A6NK53 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF233A6NK53 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF233A6NK53 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF233A6NK53 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF233A6NK53 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF233A6NK53 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF233A6NK53 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF233A6NK53 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF233A6NK53 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF233A6NK53 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF233A6NK53 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF233A6NK53 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF233A6NK53 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF233A6NK53 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF233A6NK53 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZNF233A6NK53 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZNF233A6NK53 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZNF233A6NK53 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZNF233A6NK53 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF233A6NK53 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF233A6NK53 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF233A6NK53 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF233A6NK53 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF233A6NK53 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF233A6NK53 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF233A6NK53 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF233A6NK53 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF233A6NK53 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF233A6NK53 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF233A6NK53 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF233A6NK53 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF233A6NK53 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF233A6NK53 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF233A6NK53 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF233A6NK53 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF233A6NK53 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF233A6NK53 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF233A6NK53 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF233A6NK53 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF233A6NK53 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF233A6NK53 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF233A6NK53 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF233A6NK53 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF233A6NK53 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF233A6NK53 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF233A6NK53 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF233A6NK53 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF233A6NK53 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF233A6NK53 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF233A6NK53 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF233A6NK53 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF233A6NK53 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF233A6NK53 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF233A6NK53 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF233A6NK53 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF233A6NK53 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF233A6NK53 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF233A6NK53 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF233A6NK53 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF233A6NK53 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF233A6NK53 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF233A6NK53 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF233A6NK53 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF233A6NK53 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF233A6NK53 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF233A6NK53 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF233A6NK53 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms