Protein–RNA interactions for Protein: A6NDN3

GOLGA6B, Golgin subfamily A member 6B, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6BA6NDN3 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GOLGA6BA6NDN3 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GOLGA6BA6NDN3 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GOLGA6BA6NDN3 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GOLGA6BA6NDN3 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GOLGA6BA6NDN3 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GOLGA6BA6NDN3 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GOLGA6BA6NDN3 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GOLGA6BA6NDN3 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GOLGA6BA6NDN3 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GOLGA6BA6NDN3 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GOLGA6BA6NDN3 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GOLGA6BA6NDN3 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GOLGA6BA6NDN3 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GOLGA6BA6NDN3 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GOLGA6BA6NDN3 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GOLGA6BA6NDN3 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GOLGA6BA6NDN3 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GOLGA6BA6NDN3 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GOLGA6BA6NDN3 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GOLGA6BA6NDN3 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GOLGA6BA6NDN3 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GOLGA6BA6NDN3 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GOLGA6BA6NDN3 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GOLGA6BA6NDN3 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GOLGA6BA6NDN3 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GOLGA6BA6NDN3 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GOLGA6BA6NDN3 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GOLGA6BA6NDN3 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GOLGA6BA6NDN3 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GOLGA6BA6NDN3 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GOLGA6BA6NDN3 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GOLGA6BA6NDN3 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GOLGA6BA6NDN3 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GOLGA6BA6NDN3 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GOLGA6BA6NDN3 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GOLGA6BA6NDN3 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GOLGA6BA6NDN3 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GOLGA6BA6NDN3 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GOLGA6BA6NDN3 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GOLGA6BA6NDN3 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GOLGA6BA6NDN3 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GOLGA6BA6NDN3 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GOLGA6BA6NDN3 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GOLGA6BA6NDN3 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GOLGA6BA6NDN3 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GOLGA6BA6NDN3 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GOLGA6BA6NDN3 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GOLGA6BA6NDN3 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GOLGA6BA6NDN3 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GOLGA6BA6NDN3 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GOLGA6BA6NDN3 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GOLGA6BA6NDN3 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GOLGA6BA6NDN3 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GOLGA6BA6NDN3 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GOLGA6BA6NDN3 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GOLGA6BA6NDN3 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GOLGA6BA6NDN3 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GOLGA6BA6NDN3 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GOLGA6BA6NDN3 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GOLGA6BA6NDN3 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GOLGA6BA6NDN3 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GOLGA6BA6NDN3 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GOLGA6BA6NDN3 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GOLGA6BA6NDN3 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GOLGA6BA6NDN3 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GOLGA6BA6NDN3 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GOLGA6BA6NDN3 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GOLGA6BA6NDN3 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GOLGA6BA6NDN3 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GOLGA6BA6NDN3 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GOLGA6BA6NDN3 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GOLGA6BA6NDN3 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GOLGA6BA6NDN3 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GOLGA6BA6NDN3 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GOLGA6BA6NDN3 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GOLGA6BA6NDN3 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GOLGA6BA6NDN3 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GOLGA6BA6NDN3 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GOLGA6BA6NDN3 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GOLGA6BA6NDN3 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GOLGA6BA6NDN3 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GOLGA6BA6NDN3 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GOLGA6BA6NDN3 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GOLGA6BA6NDN3 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GOLGA6BA6NDN3 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GOLGA6BA6NDN3 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GOLGA6BA6NDN3 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GOLGA6BA6NDN3 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GOLGA6BA6NDN3 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GOLGA6BA6NDN3 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GOLGA6BA6NDN3 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GOLGA6BA6NDN3 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GOLGA6BA6NDN3 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GOLGA6BA6NDN3 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GOLGA6BA6NDN3 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GOLGA6BA6NDN3 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GOLGA6BA6NDN3 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GOLGA6BA6NDN3 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GOLGA6BA6NDN3 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms