Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRAMEF22A3QJZ6 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRAMEF22A3QJZ6 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRAMEF22A3QJZ6 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRAMEF22A3QJZ6 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRAMEF22A3QJZ6 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRAMEF22A3QJZ6 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRAMEF22A3QJZ6 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRAMEF22A3QJZ6 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRAMEF22A3QJZ6 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRAMEF22A3QJZ6 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRAMEF22A3QJZ6 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRAMEF22A3QJZ6 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRAMEF22A3QJZ6 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRAMEF22A3QJZ6 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRAMEF22A3QJZ6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRAMEF22A3QJZ6 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRAMEF22A3QJZ6 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
PRAMEF22A3QJZ6 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRAMEF22A3QJZ6 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRAMEF22A3QJZ6 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRAMEF22A3QJZ6 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRAMEF22A3QJZ6 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PRAMEF22A3QJZ6 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRAMEF22A3QJZ6 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRAMEF22A3QJZ6 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PRAMEF22A3QJZ6 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRAMEF22A3QJZ6 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRAMEF22A3QJZ6 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRAMEF22A3QJZ6 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRAMEF22A3QJZ6 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRAMEF22A3QJZ6 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PRAMEF22A3QJZ6 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PRAMEF22A3QJZ6 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PRAMEF22A3QJZ6 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRAMEF22A3QJZ6 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PRAMEF22A3QJZ6 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PRAMEF22A3QJZ6 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
PRAMEF22A3QJZ6 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PRAMEF22A3QJZ6 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRAMEF22A3QJZ6 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRAMEF22A3QJZ6 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRAMEF22A3QJZ6 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRAMEF22A3QJZ6 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRAMEF22A3QJZ6 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRAMEF22A3QJZ6 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRAMEF22A3QJZ6 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRAMEF22A3QJZ6 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRAMEF22A3QJZ6 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRAMEF22A3QJZ6 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRAMEF22A3QJZ6 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRAMEF22A3QJZ6 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRAMEF22A3QJZ6 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRAMEF22A3QJZ6 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRAMEF22A3QJZ6 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRAMEF22A3QJZ6 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRAMEF22A3QJZ6 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRAMEF22A3QJZ6 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRAMEF22A3QJZ6 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRAMEF22A3QJZ6 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRAMEF22A3QJZ6 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRAMEF22A3QJZ6 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRAMEF22A3QJZ6 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PRAMEF22A3QJZ6 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PRAMEF22A3QJZ6 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PRAMEF22A3QJZ6 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRAMEF22A3QJZ6 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRAMEF22A3QJZ6 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRAMEF22A3QJZ6 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRAMEF22A3QJZ6 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRAMEF22A3QJZ6 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRAMEF22A3QJZ6 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRAMEF22A3QJZ6 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRAMEF22A3QJZ6 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRAMEF22A3QJZ6 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRAMEF22A3QJZ6 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRAMEF22A3QJZ6 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRAMEF22A3QJZ6 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRAMEF22A3QJZ6 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRAMEF22A3QJZ6 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PRAMEF22A3QJZ6 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRAMEF22A3QJZ6 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRAMEF22A3QJZ6 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRAMEF22A3QJZ6 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRAMEF22A3QJZ6 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRAMEF22A3QJZ6 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PRAMEF22A3QJZ6 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRAMEF22A3QJZ6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRAMEF22A3QJZ6 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRAMEF22A3QJZ6 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRAMEF22A3QJZ6 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRAMEF22A3QJZ6 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRAMEF22A3QJZ6 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PRAMEF22A3QJZ6 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRAMEF22A3QJZ6 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRAMEF22A3QJZ6 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRAMEF22A3QJZ6 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms