Protein–RNA interactions for Protein: A0A0D9SFI3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0D9SFI3 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
A0A0D9SFI3 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
A0A0D9SFI3 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
A0A0D9SFI3 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
A0A0D9SFI3 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
A0A0D9SFI3 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
A0A0D9SFI3 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
A0A0D9SFI3 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
A0A0D9SFI3 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
A0A0D9SFI3 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
A0A0D9SFI3 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
A0A0D9SFI3 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
A0A0D9SFI3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
A0A0D9SFI3 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
A0A0D9SFI3 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
A0A0D9SFI3 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
A0A0D9SFI3 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
A0A0D9SFI3 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
A0A0D9SFI3 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
A0A0D9SFI3 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
A0A0D9SFI3 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
A0A0D9SFI3 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
A0A0D9SFI3 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
A0A0D9SFI3 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
A0A0D9SFI3 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
A0A0D9SFI3 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
A0A0D9SFI3 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
A0A0D9SFI3 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
A0A0D9SFI3 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
A0A0D9SFI3 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
A0A0D9SFI3 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
A0A0D9SFI3 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
A0A0D9SFI3 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
A0A0D9SFI3 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
A0A0D9SFI3 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
A0A0D9SFI3 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
A0A0D9SFI3 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
A0A0D9SFI3 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
A0A0D9SFI3 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
A0A0D9SFI3 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
A0A0D9SFI3 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
A0A0D9SFI3 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
A0A0D9SFI3 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
A0A0D9SFI3 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
A0A0D9SFI3 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
A0A0D9SFI3 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
A0A0D9SFI3 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
A0A0D9SFI3 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
A0A0D9SFI3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
A0A0D9SFI3 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
A0A0D9SFI3 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
A0A0D9SFI3 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
A0A0D9SFI3 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
A0A0D9SFI3 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
A0A0D9SFI3 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
A0A0D9SFI3 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
A0A0D9SFI3 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
A0A0D9SFI3 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
A0A0D9SFI3 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
A0A0D9SFI3 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
A0A0D9SFI3 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
A0A0D9SFI3 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
A0A0D9SFI3 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
A0A0D9SFI3 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
A0A0D9SFI3 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
A0A0D9SFI3 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
A0A0D9SFI3 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
A0A0D9SFI3 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
A0A0D9SFI3 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
A0A0D9SFI3 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
A0A0D9SFI3 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
A0A0D9SFI3 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
A0A0D9SFI3 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
A0A0D9SFI3 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
A0A0D9SFI3 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
A0A0D9SFI3 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
A0A0D9SFI3 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
A0A0D9SFI3 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
A0A0D9SFI3 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
A0A0D9SFI3 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
A0A0D9SFI3 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
A0A0D9SFI3 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
A0A0D9SFI3 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
A0A0D9SFI3 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
A0A0D9SFI3 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
A0A0D9SFI3 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
A0A0D9SFI3 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
A0A0D9SFI3 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
A0A0D9SFI3 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
A0A0D9SFI3 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
A0A0D9SFI3 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
A0A0D9SFI3 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
A0A0D9SFI3 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
A0A0D9SFI3 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
A0A0D9SFI3 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
A0A0D9SFI3 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
A0A0D9SFI3 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
A0A0D9SFI3 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
A0A0D9SFI3 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
A0A0D9SFI3 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms