Protein–RNA interactions for Protein: P43088

PTGFR, Prostaglandin F2-alpha receptor, humanhuman

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGFRP43088 OR7E8P-201ENST00000532847 1000 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 AMN1-207ENST00000536761 1025 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 AMN1-212ENST00000542781 879 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 AC087863.1-201ENST00000544515 570 ntTSL 4 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 AC004828.1-201ENST00000555303 654 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 AC110027.1-201ENST00000557753 403 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 LINC02345-202ENST00000558081 1147 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 AC087761.1-201ENST00000568836 556 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 SKA2-203ENST00000578105 689 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 RN7SL711P-201ENST00000579731 299 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 AC004257.1-201ENST00000593588 277 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 AL358335.3-201ENST00000604678 327 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 LINC02018-202ENST00000608707 445 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 CCL4L2-211ENST00000613173 741 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 CCL4L2-218ENST00000620576 652 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 AL356481.2-201ENST00000629902 528 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 FAM238C-205ENST00000640641 391 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 PROX1-201ENST00000261454 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 RRN3-203ENST00000429751 2198 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 KIAA1143-201ENST00000296121 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 FLJ21408-201ENST00000499939 2594 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 AL954650.1-201ENST00000430776 2051 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 CELF2-203ENST00000416382 6894 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 NTRK3-212ENST00000558676 4670 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 VAMP3-201ENST00000054666 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 ATP2C1-208ENST00000504948 4714 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 SLC9A6-214ENST00000637581 4872 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 AKR1C1-202ENST00000380872 6705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 OPALIN-204ENST00000419479 3581 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 LINC00960-202ENST00000492922 2126 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 AC024896.1-201ENST00000500632 2549 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 FSTL5-203ENST00000427802 2920 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 CNNM2-202ENST00000369878 15857 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 AC008537.3-201ENST00000623128 1881 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 NASP-201ENST00000350030 3207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 R3HCC1L-203ENST00000370584 3372 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 GAPVD1-204ENST00000394083 4747 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 STXBP5-AS1-209ENST00000606831 2025 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 NAT1-206ENST00000518029 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 PTBP3-205ENST00000374257 7240 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 SLC9B2-201ENST00000362026 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 SLC25A24-202ENST00000370041 3404 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 CPA2-201ENST00000222481 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 CSTF2T-201ENST00000331173 4105 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 GCNT7-202ENST00000617620 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 TDRD3-209ENST00000621840 2497 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 TMEM99-204ENST00000622451 2073 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 CFAP47-201ENST00000297866 3608 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 LINC01358-211ENST00000635571 1687 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 THOC5-216ENST00000490103 4753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 NUP98-202ENST00000355260 5628 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 HCP5-201ENST00000414046 2658 ntTSL 4 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 EMC4-202ENST00000267750 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 AC211476.4-201ENST00000275546 699 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 PSMD10-203ENST00000340200 713 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 PSMD10-204ENST00000361815 768 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 MAS1L-201ENST00000377127 1260 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 SMIM30-201ENST00000397764 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 PMS2P5-201ENST00000398065 516 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 GHRHR-204ENST00000409316 1292 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 RPS14P4-201ENST00000415880 418 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 ISX-AS1-201ENST00000427881 202 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 PAICSP5-201ENST00000430406 1217 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 CD46P1-201ENST00000441364 763 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 ZRANB2-AS1-202ENST00000450461 553 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 AC104164.4-201ENST00000483456 493 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 TDGF1P3-201ENST00000493351 567 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 TMEM267-202ENST00000500337 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 AC010307.4-202ENST00000507403 389 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 AC073848.1-201ENST00000514339 457 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 BRIX1P1-201ENST00000521785 908 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 ATOX1-205ENST00000522314 724 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 SDHD-203ENST00000526592 861 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 SCAND2P-204ENST00000541103 669 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 AC073651.1-201ENST00000544015 465 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 AC013452.1-201ENST00000560630 598 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 AC034105.5-201ENST00000564017 314 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 PDE6G-202ENST00000571004 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 AC090774.3-201ENST00000578666 742 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 AC096708.1-201ENST00000584419 658 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 RPIAP1-201ENST00000587900 742 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 WFDC21P-207ENST00000590346 630 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 AC174071.1-201ENST00000603069 517 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 ZNF30-AS1-201ENST00000604333 625 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 AL356458.1-201ENST00000604764 465 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 PDZK1P1-203ENST00000616036 577 ntTSL 4 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 AL139351.1-201ENST00000622092 320 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 MIPOL1-211ENST00000556451 2282 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 SIPA1L1-211ENST00000555818 7831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 ERBB3-213ENST00000549832 3289 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 AKR1C4-202ENST00000380448 1414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 ANXA2-204ENST00000451270 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 RBMS3-201ENST00000273139 1598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 DCAF4-212ENST00000553457 2896 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 TRIM66-202ENST00000402157 10086 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 CREM-208ENST00000361599 2170 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 WDR87-202ENST00000447313 9009 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 AC009044.1-201ENST00000624577 1798 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 FDFT1-212ENST00000528643 1909 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 NCOA4-205ENST00000583565 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
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