Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R9

CCDC61, Coiled-coil domain-containing protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC61Q9Y6R9 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC61Q9Y6R9 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC61Q9Y6R9 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC61Q9Y6R9 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC61Q9Y6R9 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC61Q9Y6R9 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC61Q9Y6R9 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CCDC61Q9Y6R9 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CCDC61Q9Y6R9 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC61Q9Y6R9 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC61Q9Y6R9 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC61Q9Y6R9 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC61Q9Y6R9 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC61Q9Y6R9 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC61Q9Y6R9 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC61Q9Y6R9 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC61Q9Y6R9 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC61Q9Y6R9 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC61Q9Y6R9 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC61Q9Y6R9 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC61Q9Y6R9 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC61Q9Y6R9 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC61Q9Y6R9 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC61Q9Y6R9 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC61Q9Y6R9 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC61Q9Y6R9 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC61Q9Y6R9 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC61Q9Y6R9 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC61Q9Y6R9 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC61Q9Y6R9 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC61Q9Y6R9 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC61Q9Y6R9 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC61Q9Y6R9 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC61Q9Y6R9 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC61Q9Y6R9 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC61Q9Y6R9 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC61Q9Y6R9 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC61Q9Y6R9 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC61Q9Y6R9 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC61Q9Y6R9 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC61Q9Y6R9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC61Q9Y6R9 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC61Q9Y6R9 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC61Q9Y6R9 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC61Q9Y6R9 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC61Q9Y6R9 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC61Q9Y6R9 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC61Q9Y6R9 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC61Q9Y6R9 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC61Q9Y6R9 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC61Q9Y6R9 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC61Q9Y6R9 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC61Q9Y6R9 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC61Q9Y6R9 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC61Q9Y6R9 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC61Q9Y6R9 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC61Q9Y6R9 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC61Q9Y6R9 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC61Q9Y6R9 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC61Q9Y6R9 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC61Q9Y6R9 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC61Q9Y6R9 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC61Q9Y6R9 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC61Q9Y6R9 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC61Q9Y6R9 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC61Q9Y6R9 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC61Q9Y6R9 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC61Q9Y6R9 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC61Q9Y6R9 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC61Q9Y6R9 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC61Q9Y6R9 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC61Q9Y6R9 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC61Q9Y6R9 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC61Q9Y6R9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC61Q9Y6R9 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC61Q9Y6R9 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC61Q9Y6R9 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC61Q9Y6R9 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC61Q9Y6R9 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC61Q9Y6R9 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC61Q9Y6R9 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC61Q9Y6R9 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC61Q9Y6R9 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC61Q9Y6R9 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC61Q9Y6R9 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC61Q9Y6R9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC61Q9Y6R9 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC61Q9Y6R9 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC61Q9Y6R9 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC61Q9Y6R9 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC61Q9Y6R9 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC61Q9Y6R9 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC61Q9Y6R9 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC61Q9Y6R9 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC61Q9Y6R9 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC61Q9Y6R9 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC61Q9Y6R9 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC61Q9Y6R9 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC61Q9Y6R9 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC61Q9Y6R9 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms