Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q6

TNFRSF11A, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 11A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF11AQ9Y6Q6 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNFRSF11AQ9Y6Q6 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNFRSF11AQ9Y6Q6 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNFRSF11AQ9Y6Q6 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNFRSF11AQ9Y6Q6 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNFRSF11AQ9Y6Q6 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNFRSF11AQ9Y6Q6 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNFRSF11AQ9Y6Q6 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNFRSF11AQ9Y6Q6 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNFRSF11AQ9Y6Q6 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNFRSF11AQ9Y6Q6 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNFRSF11AQ9Y6Q6 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TNFRSF11AQ9Y6Q6 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
TNFRSF11AQ9Y6Q6 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
TNFRSF11AQ9Y6Q6 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
TNFRSF11AQ9Y6Q6 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TNFRSF11AQ9Y6Q6 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNFRSF11AQ9Y6Q6 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNFRSF11AQ9Y6Q6 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TNFRSF11AQ9Y6Q6 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNFRSF11AQ9Y6Q6 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNFRSF11AQ9Y6Q6 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNFRSF11AQ9Y6Q6 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNFRSF11AQ9Y6Q6 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNFRSF11AQ9Y6Q6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNFRSF11AQ9Y6Q6 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TNFRSF11AQ9Y6Q6 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNFRSF11AQ9Y6Q6 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TNFRSF11AQ9Y6Q6 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNFRSF11AQ9Y6Q6 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNFRSF11AQ9Y6Q6 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNFRSF11AQ9Y6Q6 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNFRSF11AQ9Y6Q6 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNFRSF11AQ9Y6Q6 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNFRSF11AQ9Y6Q6 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNFRSF11AQ9Y6Q6 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNFRSF11AQ9Y6Q6 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TNFRSF11AQ9Y6Q6 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TNFRSF11AQ9Y6Q6 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNFRSF11AQ9Y6Q6 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNFRSF11AQ9Y6Q6 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNFRSF11AQ9Y6Q6 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNFRSF11AQ9Y6Q6 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNFRSF11AQ9Y6Q6 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNFRSF11AQ9Y6Q6 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNFRSF11AQ9Y6Q6 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNFRSF11AQ9Y6Q6 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNFRSF11AQ9Y6Q6 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNFRSF11AQ9Y6Q6 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNFRSF11AQ9Y6Q6 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNFRSF11AQ9Y6Q6 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNFRSF11AQ9Y6Q6 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNFRSF11AQ9Y6Q6 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNFRSF11AQ9Y6Q6 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNFRSF11AQ9Y6Q6 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNFRSF11AQ9Y6Q6 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNFRSF11AQ9Y6Q6 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNFRSF11AQ9Y6Q6 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNFRSF11AQ9Y6Q6 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNFRSF11AQ9Y6Q6 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNFRSF11AQ9Y6Q6 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNFRSF11AQ9Y6Q6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNFRSF11AQ9Y6Q6 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNFRSF11AQ9Y6Q6 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNFRSF11AQ9Y6Q6 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNFRSF11AQ9Y6Q6 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNFRSF11AQ9Y6Q6 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNFRSF11AQ9Y6Q6 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNFRSF11AQ9Y6Q6 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNFRSF11AQ9Y6Q6 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNFRSF11AQ9Y6Q6 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNFRSF11AQ9Y6Q6 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNFRSF11AQ9Y6Q6 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNFRSF11AQ9Y6Q6 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNFRSF11AQ9Y6Q6 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNFRSF11AQ9Y6Q6 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNFRSF11AQ9Y6Q6 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNFRSF11AQ9Y6Q6 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNFRSF11AQ9Y6Q6 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNFRSF11AQ9Y6Q6 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNFRSF11AQ9Y6Q6 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms