Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5R8

TRAPPC1, Trafficking protein particle complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC1Q9Y5R8 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms