Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D8

HECTD4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HECTD4, humanhuman

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Length 3,996 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4Q9Y4D8 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HECTD4Q9Y4D8 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HECTD4Q9Y4D8 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HECTD4Q9Y4D8 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HECTD4Q9Y4D8 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HECTD4Q9Y4D8 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HECTD4Q9Y4D8 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HECTD4Q9Y4D8 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HECTD4Q9Y4D8 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HECTD4Q9Y4D8 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HECTD4Q9Y4D8 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HECTD4Q9Y4D8 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HECTD4Q9Y4D8 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HECTD4Q9Y4D8 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HECTD4Q9Y4D8 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HECTD4Q9Y4D8 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HECTD4Q9Y4D8 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HECTD4Q9Y4D8 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HECTD4Q9Y4D8 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HECTD4Q9Y4D8 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HECTD4Q9Y4D8 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HECTD4Q9Y4D8 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HECTD4Q9Y4D8 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HECTD4Q9Y4D8 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HECTD4Q9Y4D8 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HECTD4Q9Y4D8 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HECTD4Q9Y4D8 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HECTD4Q9Y4D8 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HECTD4Q9Y4D8 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HECTD4Q9Y4D8 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HECTD4Q9Y4D8 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HECTD4Q9Y4D8 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HECTD4Q9Y4D8 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HECTD4Q9Y4D8 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HECTD4Q9Y4D8 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HECTD4Q9Y4D8 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HECTD4Q9Y4D8 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HECTD4Q9Y4D8 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HECTD4Q9Y4D8 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HECTD4Q9Y4D8 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HECTD4Q9Y4D8 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HECTD4Q9Y4D8 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HECTD4Q9Y4D8 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HECTD4Q9Y4D8 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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HECTD4Q9Y4D8 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HECTD4Q9Y4D8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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HECTD4Q9Y4D8 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HECTD4Q9Y4D8 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HECTD4Q9Y4D8 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HECTD4Q9Y4D8 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HECTD4Q9Y4D8 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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HECTD4Q9Y4D8 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
HECTD4Q9Y4D8 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HECTD4Q9Y4D8 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HECTD4Q9Y4D8 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
HECTD4Q9Y4D8 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
HECTD4Q9Y4D8 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
HECTD4Q9Y4D8 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
HECTD4Q9Y4D8 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
HECTD4Q9Y4D8 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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HECTD4Q9Y4D8 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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HECTD4Q9Y4D8 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HECTD4Q9Y4D8 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HECTD4Q9Y4D8 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HECTD4Q9Y4D8 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HECTD4Q9Y4D8 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HECTD4Q9Y4D8 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
HECTD4Q9Y4D8 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HECTD4Q9Y4D8 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
HECTD4Q9Y4D8 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
HECTD4Q9Y4D8 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HECTD4Q9Y4D8 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HECTD4Q9Y4D8 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HECTD4Q9Y4D8 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HECTD4Q9Y4D8 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HECTD4Q9Y4D8 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HECTD4Q9Y4D8 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HECTD4Q9Y4D8 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HECTD4Q9Y4D8 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HECTD4Q9Y4D8 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HECTD4Q9Y4D8 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HECTD4Q9Y4D8 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HECTD4Q9Y4D8 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
HECTD4Q9Y4D8 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HECTD4Q9Y4D8 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HECTD4Q9Y4D8 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HECTD4Q9Y4D8 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HECTD4Q9Y4D8 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HECTD4Q9Y4D8 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HECTD4Q9Y4D8 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HECTD4Q9Y4D8 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HECTD4Q9Y4D8 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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