Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y496

KIF3A, Kinesin-like protein KIF3A, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF3AQ9Y496 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KIF3AQ9Y496 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
KIF3AQ9Y496 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KIF3AQ9Y496 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KIF3AQ9Y496 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KIF3AQ9Y496 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KIF3AQ9Y496 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KIF3AQ9Y496 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KIF3AQ9Y496 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KIF3AQ9Y496 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KIF3AQ9Y496 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KIF3AQ9Y496 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KIF3AQ9Y496 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KIF3AQ9Y496 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KIF3AQ9Y496 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KIF3AQ9Y496 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KIF3AQ9Y496 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KIF3AQ9Y496 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KIF3AQ9Y496 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KIF3AQ9Y496 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KIF3AQ9Y496 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KIF3AQ9Y496 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KIF3AQ9Y496 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
KIF3AQ9Y496 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KIF3AQ9Y496 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KIF3AQ9Y496 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KIF3AQ9Y496 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KIF3AQ9Y496 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KIF3AQ9Y496 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KIF3AQ9Y496 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KIF3AQ9Y496 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KIF3AQ9Y496 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KIF3AQ9Y496 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KIF3AQ9Y496 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KIF3AQ9Y496 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KIF3AQ9Y496 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KIF3AQ9Y496 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KIF3AQ9Y496 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KIF3AQ9Y496 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KIF3AQ9Y496 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KIF3AQ9Y496 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KIF3AQ9Y496 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KIF3AQ9Y496 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KIF3AQ9Y496 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KIF3AQ9Y496 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KIF3AQ9Y496 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KIF3AQ9Y496 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
KIF3AQ9Y496 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KIF3AQ9Y496 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KIF3AQ9Y496 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KIF3AQ9Y496 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KIF3AQ9Y496 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KIF3AQ9Y496 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KIF3AQ9Y496 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KIF3AQ9Y496 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KIF3AQ9Y496 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KIF3AQ9Y496 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KIF3AQ9Y496 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KIF3AQ9Y496 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KIF3AQ9Y496 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KIF3AQ9Y496 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KIF3AQ9Y496 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KIF3AQ9Y496 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KIF3AQ9Y496 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KIF3AQ9Y496 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
KIF3AQ9Y496 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
KIF3AQ9Y496 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KIF3AQ9Y496 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KIF3AQ9Y496 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KIF3AQ9Y496 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KIF3AQ9Y496 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KIF3AQ9Y496 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KIF3AQ9Y496 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KIF3AQ9Y496 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KIF3AQ9Y496 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KIF3AQ9Y496 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KIF3AQ9Y496 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KIF3AQ9Y496 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KIF3AQ9Y496 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KIF3AQ9Y496 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KIF3AQ9Y496 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KIF3AQ9Y496 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
KIF3AQ9Y496 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KIF3AQ9Y496 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KIF3AQ9Y496 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KIF3AQ9Y496 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KIF3AQ9Y496 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
KIF3AQ9Y496 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KIF3AQ9Y496 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KIF3AQ9Y496 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KIF3AQ9Y496 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
KIF3AQ9Y496 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KIF3AQ9Y496 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KIF3AQ9Y496 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KIF3AQ9Y496 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KIF3AQ9Y496 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KIF3AQ9Y496 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KIF3AQ9Y496 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KIF3AQ9Y496 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KIF3AQ9Y496 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms