Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y385

UBE2J1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 J1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2J1Q9Y385 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBE2J1Q9Y385 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBE2J1Q9Y385 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBE2J1Q9Y385 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
UBE2J1Q9Y385 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBE2J1Q9Y385 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBE2J1Q9Y385 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBE2J1Q9Y385 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBE2J1Q9Y385 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBE2J1Q9Y385 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBE2J1Q9Y385 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBE2J1Q9Y385 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBE2J1Q9Y385 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBE2J1Q9Y385 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBE2J1Q9Y385 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBE2J1Q9Y385 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBE2J1Q9Y385 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBE2J1Q9Y385 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBE2J1Q9Y385 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBE2J1Q9Y385 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBE2J1Q9Y385 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBE2J1Q9Y385 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBE2J1Q9Y385 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBE2J1Q9Y385 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBE2J1Q9Y385 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBE2J1Q9Y385 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBE2J1Q9Y385 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
UBE2J1Q9Y385 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBE2J1Q9Y385 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBE2J1Q9Y385 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
UBE2J1Q9Y385 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBE2J1Q9Y385 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBE2J1Q9Y385 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBE2J1Q9Y385 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
UBE2J1Q9Y385 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBE2J1Q9Y385 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBE2J1Q9Y385 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBE2J1Q9Y385 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
UBE2J1Q9Y385 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
UBE2J1Q9Y385 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
UBE2J1Q9Y385 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
UBE2J1Q9Y385 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBE2J1Q9Y385 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBE2J1Q9Y385 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBE2J1Q9Y385 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBE2J1Q9Y385 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBE2J1Q9Y385 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBE2J1Q9Y385 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBE2J1Q9Y385 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBE2J1Q9Y385 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBE2J1Q9Y385 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBE2J1Q9Y385 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBE2J1Q9Y385 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBE2J1Q9Y385 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBE2J1Q9Y385 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBE2J1Q9Y385 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBE2J1Q9Y385 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBE2J1Q9Y385 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBE2J1Q9Y385 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBE2J1Q9Y385 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBE2J1Q9Y385 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBE2J1Q9Y385 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBE2J1Q9Y385 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBE2J1Q9Y385 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBE2J1Q9Y385 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE2J1Q9Y385 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE2J1Q9Y385 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE2J1Q9Y385 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE2J1Q9Y385 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE2J1Q9Y385 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE2J1Q9Y385 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE2J1Q9Y385 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE2J1Q9Y385 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE2J1Q9Y385 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE2J1Q9Y385 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE2J1Q9Y385 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE2J1Q9Y385 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE2J1Q9Y385 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE2J1Q9Y385 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE2J1Q9Y385 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE2J1Q9Y385 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE2J1Q9Y385 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE2J1Q9Y385 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE2J1Q9Y385 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE2J1Q9Y385 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE2J1Q9Y385 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE2J1Q9Y385 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE2J1Q9Y385 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE2J1Q9Y385 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE2J1Q9Y385 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE2J1Q9Y385 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE2J1Q9Y385 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE2J1Q9Y385 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE2J1Q9Y385 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE2J1Q9Y385 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE2J1Q9Y385 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE2J1Q9Y385 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE2J1Q9Y385 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE2J1Q9Y385 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE2J1Q9Y385 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms