Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2I6

NINL, Ninein-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NINLQ9Y2I6 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
NINLQ9Y2I6 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NINLQ9Y2I6 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NINLQ9Y2I6 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NINLQ9Y2I6 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NINLQ9Y2I6 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NINLQ9Y2I6 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NINLQ9Y2I6 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NINLQ9Y2I6 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NINLQ9Y2I6 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NINLQ9Y2I6 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NINLQ9Y2I6 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NINLQ9Y2I6 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NINLQ9Y2I6 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NINLQ9Y2I6 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NINLQ9Y2I6 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NINLQ9Y2I6 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NINLQ9Y2I6 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NINLQ9Y2I6 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NINLQ9Y2I6 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NINLQ9Y2I6 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NINLQ9Y2I6 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NINLQ9Y2I6 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NINLQ9Y2I6 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NINLQ9Y2I6 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NINLQ9Y2I6 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
NINLQ9Y2I6 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NINLQ9Y2I6 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NINLQ9Y2I6 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NINLQ9Y2I6 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NINLQ9Y2I6 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NINLQ9Y2I6 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NINLQ9Y2I6 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NINLQ9Y2I6 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NINLQ9Y2I6 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NINLQ9Y2I6 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NINLQ9Y2I6 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NINLQ9Y2I6 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NINLQ9Y2I6 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NINLQ9Y2I6 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
NINLQ9Y2I6 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
NINLQ9Y2I6 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
NINLQ9Y2I6 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
NINLQ9Y2I6 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NINLQ9Y2I6 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NINLQ9Y2I6 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
NINLQ9Y2I6 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NINLQ9Y2I6 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
NINLQ9Y2I6 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NINLQ9Y2I6 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NINLQ9Y2I6 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NINLQ9Y2I6 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NINLQ9Y2I6 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NINLQ9Y2I6 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NINLQ9Y2I6 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NINLQ9Y2I6 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NINLQ9Y2I6 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NINLQ9Y2I6 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NINLQ9Y2I6 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
NINLQ9Y2I6 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NINLQ9Y2I6 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NINLQ9Y2I6 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NINLQ9Y2I6 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NINLQ9Y2I6 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NINLQ9Y2I6 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NINLQ9Y2I6 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NINLQ9Y2I6 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NINLQ9Y2I6 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NINLQ9Y2I6 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NINLQ9Y2I6 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NINLQ9Y2I6 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NINLQ9Y2I6 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NINLQ9Y2I6 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NINLQ9Y2I6 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NINLQ9Y2I6 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NINLQ9Y2I6 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NINLQ9Y2I6 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NINLQ9Y2I6 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NINLQ9Y2I6 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NINLQ9Y2I6 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NINLQ9Y2I6 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
NINLQ9Y2I6 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NINLQ9Y2I6 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NINLQ9Y2I6 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NINLQ9Y2I6 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NINLQ9Y2I6 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
NINLQ9Y2I6 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NINLQ9Y2I6 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NINLQ9Y2I6 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NINLQ9Y2I6 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NINLQ9Y2I6 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NINLQ9Y2I6 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NINLQ9Y2I6 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NINLQ9Y2I6 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NINLQ9Y2I6 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NINLQ9Y2I6 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NINLQ9Y2I6 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NINLQ9Y2I6 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NINLQ9Y2I6 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NINLQ9Y2I6 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms