Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQP3

TNN, Tenascin-N, humanhuman

Predictions only

Length 1,299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNQ9UQP3 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TNNQ9UQP3 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
TNNQ9UQP3 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TNNQ9UQP3 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TNNQ9UQP3 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TNNQ9UQP3 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TNNQ9UQP3 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TNNQ9UQP3 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TNNQ9UQP3 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TNNQ9UQP3 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TNNQ9UQP3 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TNNQ9UQP3 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TNNQ9UQP3 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TNNQ9UQP3 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TNNQ9UQP3 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TNNQ9UQP3 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TNNQ9UQP3 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TNNQ9UQP3 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TNNQ9UQP3 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TNNQ9UQP3 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TNNQ9UQP3 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TNNQ9UQP3 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TNNQ9UQP3 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TNNQ9UQP3 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
TNNQ9UQP3 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TNNQ9UQP3 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TNNQ9UQP3 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TNNQ9UQP3 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
TNNQ9UQP3 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
TNNQ9UQP3 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TNNQ9UQP3 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
TNNQ9UQP3 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
TNNQ9UQP3 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TNNQ9UQP3 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TNNQ9UQP3 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TNNQ9UQP3 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TNNQ9UQP3 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TNNQ9UQP3 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TNNQ9UQP3 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TNNQ9UQP3 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TNNQ9UQP3 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TNNQ9UQP3 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TNNQ9UQP3 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TNNQ9UQP3 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TNNQ9UQP3 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TNNQ9UQP3 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TNNQ9UQP3 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TNNQ9UQP3 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TNNQ9UQP3 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TNNQ9UQP3 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TNNQ9UQP3 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TNNQ9UQP3 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TNNQ9UQP3 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TNNQ9UQP3 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TNNQ9UQP3 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TNNQ9UQP3 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TNNQ9UQP3 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TNNQ9UQP3 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TNNQ9UQP3 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TNNQ9UQP3 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNNQ9UQP3 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNNQ9UQP3 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNNQ9UQP3 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNNQ9UQP3 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNNQ9UQP3 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNNQ9UQP3 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNNQ9UQP3 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNNQ9UQP3 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNNQ9UQP3 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNNQ9UQP3 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNNQ9UQP3 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNNQ9UQP3 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNNQ9UQP3 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNNQ9UQP3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TNNQ9UQP3 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TNNQ9UQP3 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TNNQ9UQP3 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TNNQ9UQP3 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TNNQ9UQP3 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TNNQ9UQP3 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TNNQ9UQP3 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TNNQ9UQP3 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TNNQ9UQP3 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TNNQ9UQP3 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TNNQ9UQP3 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TNNQ9UQP3 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TNNQ9UQP3 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TNNQ9UQP3 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
TNNQ9UQP3 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TNNQ9UQP3 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TNNQ9UQP3 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TNNQ9UQP3 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TNNQ9UQP3 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TNNQ9UQP3 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TNNQ9UQP3 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TNNQ9UQP3 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TNNQ9UQP3 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TNNQ9UQP3 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TNNQ9UQP3 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TNNQ9UQP3 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms