Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ3

AGAP1, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP1Q9UPQ3 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AGAP1Q9UPQ3 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AGAP1Q9UPQ3 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AGAP1Q9UPQ3 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AGAP1Q9UPQ3 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AGAP1Q9UPQ3 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AGAP1Q9UPQ3 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AGAP1Q9UPQ3 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AGAP1Q9UPQ3 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AGAP1Q9UPQ3 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AGAP1Q9UPQ3 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AGAP1Q9UPQ3 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AGAP1Q9UPQ3 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
AGAP1Q9UPQ3 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AGAP1Q9UPQ3 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AGAP1Q9UPQ3 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AGAP1Q9UPQ3 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AGAP1Q9UPQ3 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
AGAP1Q9UPQ3 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
AGAP1Q9UPQ3 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AGAP1Q9UPQ3 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AGAP1Q9UPQ3 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AGAP1Q9UPQ3 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AGAP1Q9UPQ3 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AGAP1Q9UPQ3 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AGAP1Q9UPQ3 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AGAP1Q9UPQ3 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AGAP1Q9UPQ3 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AGAP1Q9UPQ3 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AGAP1Q9UPQ3 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AGAP1Q9UPQ3 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AGAP1Q9UPQ3 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AGAP1Q9UPQ3 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AGAP1Q9UPQ3 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AGAP1Q9UPQ3 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
AGAP1Q9UPQ3 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AGAP1Q9UPQ3 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
AGAP1Q9UPQ3 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
AGAP1Q9UPQ3 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
AGAP1Q9UPQ3 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AGAP1Q9UPQ3 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AGAP1Q9UPQ3 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
AGAP1Q9UPQ3 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
AGAP1Q9UPQ3 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AGAP1Q9UPQ3 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AGAP1Q9UPQ3 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AGAP1Q9UPQ3 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
AGAP1Q9UPQ3 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AGAP1Q9UPQ3 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
AGAP1Q9UPQ3 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
AGAP1Q9UPQ3 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AGAP1Q9UPQ3 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AGAP1Q9UPQ3 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
AGAP1Q9UPQ3 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
AGAP1Q9UPQ3 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AGAP1Q9UPQ3 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AGAP1Q9UPQ3 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
AGAP1Q9UPQ3 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AGAP1Q9UPQ3 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AGAP1Q9UPQ3 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
AGAP1Q9UPQ3 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
AGAP1Q9UPQ3 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
AGAP1Q9UPQ3 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AGAP1Q9UPQ3 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
AGAP1Q9UPQ3 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
AGAP1Q9UPQ3 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AGAP1Q9UPQ3 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AGAP1Q9UPQ3 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AGAP1Q9UPQ3 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AGAP1Q9UPQ3 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AGAP1Q9UPQ3 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AGAP1Q9UPQ3 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AGAP1Q9UPQ3 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AGAP1Q9UPQ3 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AGAP1Q9UPQ3 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
AGAP1Q9UPQ3 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AGAP1Q9UPQ3 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
AGAP1Q9UPQ3 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AGAP1Q9UPQ3 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AGAP1Q9UPQ3 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
AGAP1Q9UPQ3 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AGAP1Q9UPQ3 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
AGAP1Q9UPQ3 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
AGAP1Q9UPQ3 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
AGAP1Q9UPQ3 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AGAP1Q9UPQ3 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
AGAP1Q9UPQ3 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
AGAP1Q9UPQ3 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AGAP1Q9UPQ3 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
AGAP1Q9UPQ3 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AGAP1Q9UPQ3 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AGAP1Q9UPQ3 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AGAP1Q9UPQ3 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AGAP1Q9UPQ3 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AGAP1Q9UPQ3 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
AGAP1Q9UPQ3 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
AGAP1Q9UPQ3 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
AGAP1Q9UPQ3 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AGAP1Q9UPQ3 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AGAP1Q9UPQ3 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms