Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP95

SLC12A4, Solute carrier family 12 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4Q9UP95 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC12A4Q9UP95 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC12A4Q9UP95 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC12A4Q9UP95 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC12A4Q9UP95 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC12A4Q9UP95 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC12A4Q9UP95 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC12A4Q9UP95 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC12A4Q9UP95 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC12A4Q9UP95 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC12A4Q9UP95 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SLC12A4Q9UP95 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SLC12A4Q9UP95 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SLC12A4Q9UP95 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC12A4Q9UP95 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC12A4Q9UP95 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC12A4Q9UP95 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC12A4Q9UP95 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC12A4Q9UP95 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC12A4Q9UP95 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC12A4Q9UP95 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC12A4Q9UP95 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC12A4Q9UP95 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC12A4Q9UP95 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC12A4Q9UP95 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC12A4Q9UP95 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC12A4Q9UP95 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC12A4Q9UP95 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC12A4Q9UP95 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC12A4Q9UP95 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC12A4Q9UP95 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC12A4Q9UP95 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC12A4Q9UP95 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC12A4Q9UP95 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC12A4Q9UP95 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC12A4Q9UP95 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC12A4Q9UP95 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC12A4Q9UP95 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC12A4Q9UP95 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC12A4Q9UP95 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC12A4Q9UP95 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC12A4Q9UP95 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC12A4Q9UP95 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC12A4Q9UP95 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC12A4Q9UP95 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC12A4Q9UP95 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC12A4Q9UP95 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC12A4Q9UP95 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC12A4Q9UP95 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC12A4Q9UP95 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC12A4Q9UP95 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC12A4Q9UP95 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC12A4Q9UP95 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC12A4Q9UP95 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC12A4Q9UP95 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC12A4Q9UP95 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC12A4Q9UP95 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC12A4Q9UP95 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC12A4Q9UP95 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC12A4Q9UP95 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC12A4Q9UP95 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC12A4Q9UP95 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC12A4Q9UP95 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC12A4Q9UP95 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC12A4Q9UP95 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC12A4Q9UP95 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC12A4Q9UP95 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC12A4Q9UP95 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC12A4Q9UP95 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC12A4Q9UP95 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC12A4Q9UP95 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC12A4Q9UP95 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC12A4Q9UP95 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC12A4Q9UP95 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC12A4Q9UP95 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC12A4Q9UP95 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC12A4Q9UP95 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC12A4Q9UP95 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC12A4Q9UP95 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC12A4Q9UP95 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC12A4Q9UP95 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC12A4Q9UP95 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC12A4Q9UP95 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC12A4Q9UP95 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC12A4Q9UP95 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC12A4Q9UP95 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC12A4Q9UP95 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC12A4Q9UP95 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC12A4Q9UP95 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC12A4Q9UP95 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC12A4Q9UP95 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC12A4Q9UP95 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC12A4Q9UP95 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC12A4Q9UP95 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC12A4Q9UP95 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC12A4Q9UP95 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC12A4Q9UP95 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC12A4Q9UP95 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC12A4Q9UP95 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC12A4Q9UP95 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms