Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULN7

PNMA8B, Paraneoplastic antigen-like protein 8B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA8BQ9ULN7 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PNMA8BQ9ULN7 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PNMA8BQ9ULN7 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PNMA8BQ9ULN7 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PNMA8BQ9ULN7 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PNMA8BQ9ULN7 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PNMA8BQ9ULN7 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PNMA8BQ9ULN7 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PNMA8BQ9ULN7 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PNMA8BQ9ULN7 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PNMA8BQ9ULN7 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PNMA8BQ9ULN7 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PNMA8BQ9ULN7 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PNMA8BQ9ULN7 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PNMA8BQ9ULN7 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PNMA8BQ9ULN7 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PNMA8BQ9ULN7 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PNMA8BQ9ULN7 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PNMA8BQ9ULN7 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PNMA8BQ9ULN7 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PNMA8BQ9ULN7 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PNMA8BQ9ULN7 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PNMA8BQ9ULN7 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PNMA8BQ9ULN7 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PNMA8BQ9ULN7 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PNMA8BQ9ULN7 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PNMA8BQ9ULN7 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PNMA8BQ9ULN7 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PNMA8BQ9ULN7 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PNMA8BQ9ULN7 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PNMA8BQ9ULN7 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PNMA8BQ9ULN7 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PNMA8BQ9ULN7 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PNMA8BQ9ULN7 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PNMA8BQ9ULN7 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PNMA8BQ9ULN7 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PNMA8BQ9ULN7 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PNMA8BQ9ULN7 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PNMA8BQ9ULN7 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PNMA8BQ9ULN7 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PNMA8BQ9ULN7 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PNMA8BQ9ULN7 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PNMA8BQ9ULN7 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PNMA8BQ9ULN7 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PNMA8BQ9ULN7 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PNMA8BQ9ULN7 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PNMA8BQ9ULN7 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PNMA8BQ9ULN7 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PNMA8BQ9ULN7 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PNMA8BQ9ULN7 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PNMA8BQ9ULN7 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PNMA8BQ9ULN7 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PNMA8BQ9ULN7 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PNMA8BQ9ULN7 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PNMA8BQ9ULN7 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PNMA8BQ9ULN7 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PNMA8BQ9ULN7 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PNMA8BQ9ULN7 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PNMA8BQ9ULN7 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PNMA8BQ9ULN7 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PNMA8BQ9ULN7 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PNMA8BQ9ULN7 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PNMA8BQ9ULN7 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PNMA8BQ9ULN7 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PNMA8BQ9ULN7 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PNMA8BQ9ULN7 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PNMA8BQ9ULN7 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PNMA8BQ9ULN7 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PNMA8BQ9ULN7 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PNMA8BQ9ULN7 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PNMA8BQ9ULN7 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PNMA8BQ9ULN7 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PNMA8BQ9ULN7 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PNMA8BQ9ULN7 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PNMA8BQ9ULN7 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PNMA8BQ9ULN7 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PNMA8BQ9ULN7 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PNMA8BQ9ULN7 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PNMA8BQ9ULN7 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PNMA8BQ9ULN7 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PNMA8BQ9ULN7 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PNMA8BQ9ULN7 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PNMA8BQ9ULN7 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PNMA8BQ9ULN7 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PNMA8BQ9ULN7 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PNMA8BQ9ULN7 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PNMA8BQ9ULN7 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PNMA8BQ9ULN7 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PNMA8BQ9ULN7 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PNMA8BQ9ULN7 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PNMA8BQ9ULN7 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PNMA8BQ9ULN7 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PNMA8BQ9ULN7 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PNMA8BQ9ULN7 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PNMA8BQ9ULN7 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PNMA8BQ9ULN7 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PNMA8BQ9ULN7 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PNMA8BQ9ULN7 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PNMA8BQ9ULN7 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PNMA8BQ9ULN7 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms