Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJJ7

RPUSD1, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD1Q9UJJ7 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RPUSD1Q9UJJ7 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RPUSD1Q9UJJ7 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
RPUSD1Q9UJJ7 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RPUSD1Q9UJJ7 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RPUSD1Q9UJJ7 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RPUSD1Q9UJJ7 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RPUSD1Q9UJJ7 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RPUSD1Q9UJJ7 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RPUSD1Q9UJJ7 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RPUSD1Q9UJJ7 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RPUSD1Q9UJJ7 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPUSD1Q9UJJ7 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPUSD1Q9UJJ7 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPUSD1Q9UJJ7 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
RPUSD1Q9UJJ7 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPUSD1Q9UJJ7 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPUSD1Q9UJJ7 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPUSD1Q9UJJ7 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
RPUSD1Q9UJJ7 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPUSD1Q9UJJ7 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPUSD1Q9UJJ7 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPUSD1Q9UJJ7 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPUSD1Q9UJJ7 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPUSD1Q9UJJ7 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPUSD1Q9UJJ7 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
RPUSD1Q9UJJ7 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
RPUSD1Q9UJJ7 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPUSD1Q9UJJ7 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPUSD1Q9UJJ7 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
RPUSD1Q9UJJ7 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPUSD1Q9UJJ7 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPUSD1Q9UJJ7 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPUSD1Q9UJJ7 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPUSD1Q9UJJ7 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPUSD1Q9UJJ7 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPUSD1Q9UJJ7 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPUSD1Q9UJJ7 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPUSD1Q9UJJ7 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPUSD1Q9UJJ7 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPUSD1Q9UJJ7 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPUSD1Q9UJJ7 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPUSD1Q9UJJ7 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPUSD1Q9UJJ7 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPUSD1Q9UJJ7 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPUSD1Q9UJJ7 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPUSD1Q9UJJ7 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPUSD1Q9UJJ7 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPUSD1Q9UJJ7 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPUSD1Q9UJJ7 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
RPUSD1Q9UJJ7 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPUSD1Q9UJJ7 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPUSD1Q9UJJ7 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPUSD1Q9UJJ7 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPUSD1Q9UJJ7 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPUSD1Q9UJJ7 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPUSD1Q9UJJ7 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPUSD1Q9UJJ7 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPUSD1Q9UJJ7 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPUSD1Q9UJJ7 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPUSD1Q9UJJ7 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPUSD1Q9UJJ7 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPUSD1Q9UJJ7 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPUSD1Q9UJJ7 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPUSD1Q9UJJ7 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPUSD1Q9UJJ7 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPUSD1Q9UJJ7 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPUSD1Q9UJJ7 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPUSD1Q9UJJ7 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPUSD1Q9UJJ7 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPUSD1Q9UJJ7 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
RPUSD1Q9UJJ7 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPUSD1Q9UJJ7 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPUSD1Q9UJJ7 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPUSD1Q9UJJ7 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
RPUSD1Q9UJJ7 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPUSD1Q9UJJ7 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPUSD1Q9UJJ7 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPUSD1Q9UJJ7 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPUSD1Q9UJJ7 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPUSD1Q9UJJ7 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPUSD1Q9UJJ7 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPUSD1Q9UJJ7 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPUSD1Q9UJJ7 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPUSD1Q9UJJ7 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPUSD1Q9UJJ7 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPUSD1Q9UJJ7 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPUSD1Q9UJJ7 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPUSD1Q9UJJ7 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPUSD1Q9UJJ7 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPUSD1Q9UJJ7 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPUSD1Q9UJJ7 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPUSD1Q9UJJ7 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
RPUSD1Q9UJJ7 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RPUSD1Q9UJJ7 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RPUSD1Q9UJJ7 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RPUSD1Q9UJJ7 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RPUSD1Q9UJJ7 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RPUSD1Q9UJJ7 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RPUSD1Q9UJJ7 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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