Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MBD1Q9UIS9 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MBD1Q9UIS9 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MBD1Q9UIS9 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MBD1Q9UIS9 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MBD1Q9UIS9 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MBD1Q9UIS9 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MBD1Q9UIS9 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MBD1Q9UIS9 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MBD1Q9UIS9 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MBD1Q9UIS9 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MBD1Q9UIS9 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
MBD1Q9UIS9 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
MBD1Q9UIS9 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MBD1Q9UIS9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MBD1Q9UIS9 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MBD1Q9UIS9 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MBD1Q9UIS9 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MBD1Q9UIS9 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MBD1Q9UIS9 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MBD1Q9UIS9 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MBD1Q9UIS9 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MBD1Q9UIS9 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MBD1Q9UIS9 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MBD1Q9UIS9 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MBD1Q9UIS9 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MBD1Q9UIS9 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MBD1Q9UIS9 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MBD1Q9UIS9 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MBD1Q9UIS9 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MBD1Q9UIS9 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MBD1Q9UIS9 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MBD1Q9UIS9 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
MBD1Q9UIS9 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MBD1Q9UIS9 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MBD1Q9UIS9 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
MBD1Q9UIS9 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MBD1Q9UIS9 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MBD1Q9UIS9 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MBD1Q9UIS9 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MBD1Q9UIS9 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MBD1Q9UIS9 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
MBD1Q9UIS9 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MBD1Q9UIS9 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MBD1Q9UIS9 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MBD1Q9UIS9 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MBD1Q9UIS9 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MBD1Q9UIS9 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MBD1Q9UIS9 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MBD1Q9UIS9 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MBD1Q9UIS9 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MBD1Q9UIS9 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MBD1Q9UIS9 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MBD1Q9UIS9 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MBD1Q9UIS9 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MBD1Q9UIS9 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MBD1Q9UIS9 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MBD1Q9UIS9 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MBD1Q9UIS9 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MBD1Q9UIS9 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MBD1Q9UIS9 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MBD1Q9UIS9 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MBD1Q9UIS9 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MBD1Q9UIS9 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MBD1Q9UIS9 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MBD1Q9UIS9 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MBD1Q9UIS9 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MBD1Q9UIS9 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MBD1Q9UIS9 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MBD1Q9UIS9 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MBD1Q9UIS9 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MBD1Q9UIS9 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
MBD1Q9UIS9 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MBD1Q9UIS9 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MBD1Q9UIS9 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MBD1Q9UIS9 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MBD1Q9UIS9 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MBD1Q9UIS9 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
MBD1Q9UIS9 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MBD1Q9UIS9 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
MBD1Q9UIS9 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
MBD1Q9UIS9 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MBD1Q9UIS9 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MBD1Q9UIS9 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MBD1Q9UIS9 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MBD1Q9UIS9 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
MBD1Q9UIS9 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MBD1Q9UIS9 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
MBD1Q9UIS9 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MBD1Q9UIS9 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MBD1Q9UIS9 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MBD1Q9UIS9 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MBD1Q9UIS9 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MBD1Q9UIS9 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MBD1Q9UIS9 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MBD1Q9UIS9 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MBD1Q9UIS9 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MBD1Q9UIS9 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MBD1Q9UIS9 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MBD1Q9UIS9 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms