Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NPC1L1Q9UHC9 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NPC1L1Q9UHC9 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NPC1L1Q9UHC9 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NPC1L1Q9UHC9 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NPC1L1Q9UHC9 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
NPC1L1Q9UHC9 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
NPC1L1Q9UHC9 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NPC1L1Q9UHC9 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NPC1L1Q9UHC9 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NPC1L1Q9UHC9 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NPC1L1Q9UHC9 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NPC1L1Q9UHC9 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NPC1L1Q9UHC9 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NPC1L1Q9UHC9 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NPC1L1Q9UHC9 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NPC1L1Q9UHC9 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NPC1L1Q9UHC9 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NPC1L1Q9UHC9 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
NPC1L1Q9UHC9 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NPC1L1Q9UHC9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NPC1L1Q9UHC9 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NPC1L1Q9UHC9 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NPC1L1Q9UHC9 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NPC1L1Q9UHC9 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NPC1L1Q9UHC9 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NPC1L1Q9UHC9 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NPC1L1Q9UHC9 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NPC1L1Q9UHC9 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NPC1L1Q9UHC9 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NPC1L1Q9UHC9 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NPC1L1Q9UHC9 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NPC1L1Q9UHC9 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NPC1L1Q9UHC9 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
NPC1L1Q9UHC9 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
NPC1L1Q9UHC9 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NPC1L1Q9UHC9 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NPC1L1Q9UHC9 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NPC1L1Q9UHC9 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NPC1L1Q9UHC9 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NPC1L1Q9UHC9 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NPC1L1Q9UHC9 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NPC1L1Q9UHC9 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NPC1L1Q9UHC9 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NPC1L1Q9UHC9 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NPC1L1Q9UHC9 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NPC1L1Q9UHC9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NPC1L1Q9UHC9 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NPC1L1Q9UHC9 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NPC1L1Q9UHC9 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NPC1L1Q9UHC9 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
NPC1L1Q9UHC9 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NPC1L1Q9UHC9 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NPC1L1Q9UHC9 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NPC1L1Q9UHC9 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NPC1L1Q9UHC9 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NPC1L1Q9UHC9 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NPC1L1Q9UHC9 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NPC1L1Q9UHC9 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NPC1L1Q9UHC9 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NPC1L1Q9UHC9 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NPC1L1Q9UHC9 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NPC1L1Q9UHC9 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NPC1L1Q9UHC9 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NPC1L1Q9UHC9 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NPC1L1Q9UHC9 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NPC1L1Q9UHC9 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NPC1L1Q9UHC9 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NPC1L1Q9UHC9 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NPC1L1Q9UHC9 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NPC1L1Q9UHC9 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NPC1L1Q9UHC9 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NPC1L1Q9UHC9 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NPC1L1Q9UHC9 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NPC1L1Q9UHC9 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NPC1L1Q9UHC9 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
NPC1L1Q9UHC9 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NPC1L1Q9UHC9 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NPC1L1Q9UHC9 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NPC1L1Q9UHC9 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NPC1L1Q9UHC9 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NPC1L1Q9UHC9 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NPC1L1Q9UHC9 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NPC1L1Q9UHC9 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NPC1L1Q9UHC9 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NPC1L1Q9UHC9 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NPC1L1Q9UHC9 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NPC1L1Q9UHC9 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NPC1L1Q9UHC9 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NPC1L1Q9UHC9 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NPC1L1Q9UHC9 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NPC1L1Q9UHC9 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NPC1L1Q9UHC9 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NPC1L1Q9UHC9 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
NPC1L1Q9UHC9 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NPC1L1Q9UHC9 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NPC1L1Q9UHC9 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NPC1L1Q9UHC9 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NPC1L1Q9UHC9 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
NPC1L1Q9UHC9 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms