Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
COPS7AQ9UBW8 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
COPS7AQ9UBW8 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
COPS7AQ9UBW8 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
COPS7AQ9UBW8 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
COPS7AQ9UBW8 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
COPS7AQ9UBW8 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
COPS7AQ9UBW8 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
COPS7AQ9UBW8 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
COPS7AQ9UBW8 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
COPS7AQ9UBW8 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
COPS7AQ9UBW8 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
COPS7AQ9UBW8 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
COPS7AQ9UBW8 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COPS7AQ9UBW8 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COPS7AQ9UBW8 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
COPS7AQ9UBW8 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
COPS7AQ9UBW8 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
COPS7AQ9UBW8 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
COPS7AQ9UBW8 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
COPS7AQ9UBW8 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COPS7AQ9UBW8 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
COPS7AQ9UBW8 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COPS7AQ9UBW8 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
COPS7AQ9UBW8 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
COPS7AQ9UBW8 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
COPS7AQ9UBW8 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
COPS7AQ9UBW8 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
COPS7AQ9UBW8 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
COPS7AQ9UBW8 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
COPS7AQ9UBW8 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COPS7AQ9UBW8 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COPS7AQ9UBW8 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COPS7AQ9UBW8 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
COPS7AQ9UBW8 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
COPS7AQ9UBW8 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COPS7AQ9UBW8 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COPS7AQ9UBW8 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
COPS7AQ9UBW8 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
COPS7AQ9UBW8 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
COPS7AQ9UBW8 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
COPS7AQ9UBW8 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
COPS7AQ9UBW8 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
COPS7AQ9UBW8 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
COPS7AQ9UBW8 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
COPS7AQ9UBW8 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
COPS7AQ9UBW8 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
COPS7AQ9UBW8 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
COPS7AQ9UBW8 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
COPS7AQ9UBW8 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
COPS7AQ9UBW8 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
COPS7AQ9UBW8 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
COPS7AQ9UBW8 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
COPS7AQ9UBW8 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
COPS7AQ9UBW8 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
COPS7AQ9UBW8 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
COPS7AQ9UBW8 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
COPS7AQ9UBW8 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
COPS7AQ9UBW8 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
COPS7AQ9UBW8 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
COPS7AQ9UBW8 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
COPS7AQ9UBW8 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
COPS7AQ9UBW8 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
COPS7AQ9UBW8 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
COPS7AQ9UBW8 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
COPS7AQ9UBW8 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
COPS7AQ9UBW8 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
COPS7AQ9UBW8 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
COPS7AQ9UBW8 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
COPS7AQ9UBW8 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
COPS7AQ9UBW8 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
COPS7AQ9UBW8 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
COPS7AQ9UBW8 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
COPS7AQ9UBW8 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
COPS7AQ9UBW8 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
COPS7AQ9UBW8 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
COPS7AQ9UBW8 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
COPS7AQ9UBW8 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
COPS7AQ9UBW8 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
COPS7AQ9UBW8 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
COPS7AQ9UBW8 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
COPS7AQ9UBW8 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
COPS7AQ9UBW8 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
COPS7AQ9UBW8 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
COPS7AQ9UBW8 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
COPS7AQ9UBW8 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
COPS7AQ9UBW8 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
COPS7AQ9UBW8 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
COPS7AQ9UBW8 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
COPS7AQ9UBW8 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
COPS7AQ9UBW8 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
COPS7AQ9UBW8 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
COPS7AQ9UBW8 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
COPS7AQ9UBW8 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
COPS7AQ9UBW8 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
COPS7AQ9UBW8 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
COPS7AQ9UBW8 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
COPS7AQ9UBW8 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
COPS7AQ9UBW8 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
COPS7AQ9UBW8 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
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